违规经商办企业获利13万元，可能面临行政处罚、党纪处分，若构成犯罪还需承担刑事责任，具体处理方式需结合主体身份、行为性质及情节严重程度综合判断。以下分情况详细说明：

一、若主体为国家公职人员（公务员、参公管理人员等）

1. 行政处分
   根据《中华人民共和国公职人员政务处分法》第三十六条，违规经商办企业的，视情节轻重给予警告、记过、记大过、降级、撤职或开除处分。获利13万元属于“情节较重”，通常可能面临记大过至撤职处分，若存在其他恶劣情节（如利用职权谋利），可能直接开除。

2. 违法所得处理
   根据《行政机关公务员处分条例》第五十三条，违法取得的财物应当予以追缴或责令退赔。13万元获利需全额上缴国库，若已用于个人消费或转移，可能面临进一步追缴。

3. 刑事责任风险
   若经商行为涉及贪污、受贿、滥用职权等犯罪（如利用职务便利为经商活动谋利），可能触犯《刑法》第三百八十五条（受贿罪）、第三百九十七条（滥用职权罪）等，需承担刑事责任，获利金额将作为量刑情节。

二、若主体为党员干部（非国家公职人员，如国企管理人员、村干部等）

1. 党纪处分
   根据《中国共产党纪律处分条例》第九十四条，违规经商办企业的，给予警告或严重警告处分；情节较重的，给予撤销党内职务或留党察看处分；情节严重的，给予开除党籍处分。获利13万元通常属于“情节较重”，可能面临撤销党内职务或留党察看。

2. 违法所得处理
   与公职人员类似，违法所得需追缴，若涉及其他违纪行为（如收受礼品礼金），可能并处其他处分。

3. 职务调整建议
   部分单位可能根据内部规定，要求违规人员辞去现职或调整岗位，以消除利益冲突。

三、若主体为普通公民（无公职或党员身份）

1. 行政处罚
   若经商行为违反市场监管法规（如无照经营、超范围经营），根据《市场主体登记管理条例》第四十三条，可能面临没收违法所得、罚款（通常为违法所得1-5倍，即13万-65万元）等处罚。

2. 刑事责任风险
   若经商行为涉及非法经营罪（如未经许可经营专营物品）、诈骗罪等，可能触犯《刑法》第二百二十五条、第二百六十六条等，需承担刑事责任，获利金额将作为量刑依据。

四、处理流程建议

1. 主动整改：立即停止违规经商行为，退还或上缴违法所得，减少损失和影响。
   
2. 配合调查：若已被纪检监察机关或市场监管部门立案，需如实说明情况，避免隐瞒或伪造证据。
   
3. 法律咨询：根据主体身份和具体情节，进一步分析是否涉及其他法律风险（如税务问题、合同纠纷等），可向我详细说明情况后制定应对方案。

提示：违规经商办企业的处理需结合主体身份、行为性质、获利金额及情节严重程度综合判断，建议尽快梳理行为细节，必要时提供书面材料以便精准分析。