结论：事故撤销后，撤销人是否会有案底，需根据事故性质（行政或刑事）及撤销原因综合判断。以下分情况详细说明：
一、若事故属于行政案件（如轻微交通事故）
撤销原因与案底关系
若事故因情节轻微、证据不足或达成和解被撤销行政处罚（如罚款、扣分），通常不会留下案底。行政处罚记录仅在作出处罚决定时生成，撤销后相关记录会被消除或标注为“撤销”，不影响个人信用或无犯罪记录证明。
例外情形
- 若撤销前已执行处罚（如已缴纳罚款），部分地区可能保留处罚执行记录，但此类记录不属于“案底”，仅作为行政执行痕迹。
- 若事故涉及逃逸、伪造证据等违法行为，即使最终撤销处罚，公安机关可能单独对违法行为立案，此时可能留下违法记录。
二、若事故属于刑事案件（如交通肇事罪）
撤销刑事案件的情形
- 证据不足：检察院作出不起诉决定或法院判决无罪，案件撤销后不会留下刑事案底。
- 情节显著轻微：如事故未造成严重后果，且嫌疑人主观恶性小，公安机关可能撤销案件，此时无案底。
- 和解或谅解：双方达成和解且嫌疑人取得谅解，公安机关可能撤销案件（尤其适用于危险驾驶罪等轻罪），但需注意：刑事和解不等于无罪，若案件已进入司法程序，可能留下诉讼记录。
会留下案底的情形
- 案件撤销但已构成犯罪：若事故已构成交通肇事罪，但因自首、立功等情节被撤销案件或免予刑事处罚，仍会留下刑事案底（显示“犯罪记录”但标注“免予处罚”）。
- 撤销前已执行刑罚：若案件已进入执行阶段（如服刑完毕），即使后续撤销原判，案底仍会保留，但可能通过申诉或再审程序更正记录。
三、关键建议
核实撤销性质
向作出撤销决定的机关（如交警队、检察院）确认案件性质（行政/刑事）及撤销依据，明确是否涉及违法或犯罪记录。
申请无犯罪记录证明
若需证明无刑事案底，可向户籍地公安机关申请《无犯罪记录证明》，若证明中无相关记录，则说明无刑事案底。
法律程序影响
- 行政案件：撤销后一般无后续影响，但需注意部分行业（如公务员、律师）可能要求开具“无违法犯罪记录证明”，此时需确认撤销记录是否包含在内。
- 刑事案件：即使撤销，诉讼记录可能仍存在于司法档案中，对部分职业（如教师、医生）可能产生间接影响。
总结：事故撤销后是否有案底，核心取决于案件性质及撤销原因。行政案件撤销后通常无案底，刑事案件则需区分“无罪撤销”与“有罪但免罚撤销”。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合案情提供针对性分析。