针对您提出的“自然资源责令停止违法行为用土地管理法第几条”的问题，这实际上涉及到了《土地管理法》中关于违法用地行为的处罚条款。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“自然资源责令停止违法行为”，但根据违法用地的具体情形，我们可以找到相应的处罚依据。

首先，对于非法占用土地的行为：

• 违反了《土地管理法》中关于建设占用土地需办理审批手续的规定，如第四十三条、第四十四条、第五十三条、第五十九条等。
• 处罚依据主要是《土地管理法》第七十七条，该条款规定县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令退还非法占用的土地，并根据具体情况采取限期拆除、没收建筑物、罚款等措施。

其次，对于违法占用耕地的行为：

• 违反了《土地管理法》第三十七条，该条款明确禁止占用耕地进行非农业建设等破坏种植条件的行为。
• 处罚依据是《土地管理法》第七十五条，该条款规定县级以上人民政府自然资源主管部门等有权责令限期改正或者治理，并可以并处罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

最后，对于非法转让土地的行为：

• 违反了《土地管理法》第二条第三款，该条款规定任何单位和个人不得非法转让土地。
• 处罚依据是《土地管理法》第七十四条，该条款规定县级以上人民政府自然资源主管部门有权没收违法所得，并根据具体情况采取限期拆除、没收建筑物、罚款等措施。

总结来说，自然资源主管部门在责令停止违法行为时，主要依据的是《土地管理法》中关于违法用地行为的处罚条款，如第七十七条、第七十五条和第七十四条等。这些条款明确规定了对于非法占用土地、违法占用耕地以及非法转让土地等行为的处罚措施。

因此，当自然资源主管部门发现违法用地行为时，会根据具体情形选择相应的法律条款进行处罚，包括责令停止违法行为、退还非法占用的土地、限期拆除或没收建筑物、罚款乃至追究刑事责任等。希望这个解答能够帮助您更好地理解相关法律条款和处罚措施。