对刑事案件指定管辖不服的，可以通过提出管辖权异议、申请复议或申诉等途径来维护自身合法权益。具体分析如下：

1. 提出管辖权异议：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，当事人对案件的管辖有异议的，有权向受理案件的机关提出。
   • 操作方式：在刑事诉讼过程中，如果认为指定管辖的机关不符合法律规定或存在其他不当情形，可以向该机关提出书面管辖权异议，说明理由并提供相关证据。
   • 注意事项：提出异议时，应确保异议内容具体、明确，并附上相关证据材料，以便受理机关进行审查。

2. 申请复议：

   • 适用情形：如果管辖权异议被驳回，或者认为指定管辖的决定存在错误，可以向上一级机关申请复议。
   • 操作方式：在收到驳回管辖权异议的决定后，按照规定的期限和程序，向上一级机关提交复议申请书，阐述复议理由和请求。
   • 注意事项：复议申请应针对原决定的具体内容，提出明确的复议请求和理由，并附上相关证据材料。

3. 申诉：

   • 适用情形：在复议程序结束后，如果仍然对指定管辖的决定不服，或者认为复议程序存在违法情形，可以向有关机关提出申诉。
   • 操作方式：根据具体情况，向相应的机关（如上级法院、检察院等）提交申诉书，详细陈述申诉理由和请求。
   • 注意事项：申诉应基于新的事实或证据，或者指出原决定或复议决定中的法律错误。申诉程序可能较为复杂，需要耐心和细致地准备相关材料。

额外建议：

• 及时咨询：在面临刑事案件指定管辖问题时，建议及时咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
• 保留证据：在提出异议、申请复议或申诉过程中，应妥善保留相关证据材料，以便在需要时提供证明。
• 遵守程序：务必按照法律规定的期限和程序进行操作，以免因程序问题而影响自身权益。