小区夜间车辆噪音扰民的问题，主要由公安部门负责管理。以下是详细的分析与解答：
一、主要管理部门及法律依据
公安部门：
- 管理范围：对于邻里间因车辆等产生的噪声干扰他人正常生活的，公安部门有权进行管理。
- 法律依据：根据《中华人民共和国噪声污染防治法》及相关地方性法规，公安部门对违反社会生活噪声污染防治规定的行为有权进行处罚，包括警告、罚款等。
其他可能涉及的管理部门：
- 虽然主要管理责任在公安部门，但如果车辆噪音来源于特定场所（如商业经营场所的装卸货车辆），且该场所的噪音管理有专门规定，则可能涉及地方人民政府指定的部门进行管理。不过，在大多数小区夜间车辆噪音扰民的情况下，这一情形较为少见。
二、处理流程与建议
尝试沟通：
- 首先，您可以尝试与产生噪音的车辆车主进行沟通，说明噪音对您生活的影响，寻求和平解决方案。
向公安部门投诉：
- 如果沟通无果，您可以向当地公安部门投诉。投诉时，请提供详细的情况说明，包括噪音发生的时间、地点、噪音来源（如具体车辆）以及噪音对您生活的影响等。
- 公安部门在接到投诉后，会进行调查核实，并根据情况采取相应的措施，如警告、罚款等。
保留证据：
- 为了更有效地解决问题，建议您在投诉前或投诉过程中保留相关证据，如录音、视频等，以便在需要时提供给公安部门进行调查和处理。
三、可能的法律后果
- 如果车辆车主被认定为违反社会生活噪声污染防治规定，公安部门有权对其进行警告或罚款。罚款的数额根据具体违法情节和地方性法规的规定而定。
- 在极端情况下，如果车辆车主多次违反规定且拒不改正，公安部门还可以采取更严厉的措施，如暂扣车辆等（但这一措施在小区夜间车辆噪音扰民的情况下较为少见）。
四、特殊情况说明
- 如果小区夜间车辆噪音是由于道路施工、交通管制等特殊原因造成的，且这些原因超出了车主的控制范围，那么车主可能不承担法律责任。但在此情况下，您仍然可以向相关部门（如交通管理部门）反映情况，寻求解决方案。
总结：小区夜间车辆噪音扰民的问题主要由公安部门负责管理。在处理此类问题时，建议您首先尝试与车主沟通，如果沟通无果则向公安部门投诉，并保留相关证据以支持调查和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。