交通事故中和对方司机签订的协议，在一定条件下是合法的，但也存在可能导致协议无效或可撤销的情形。以下是对此问题的详细分析：
一、协议合法有效的条件
主体合格：
- 签订协议的双方需具有相应的民事行为能力，即通常是成年人在意识清醒、能够正确表达自己意志的情况下签订的协议。
意思表示真实：
- 协议必须是双方基于真实意愿而签订，不存在任何欺诈、胁迫等不正当手段。例如，双方对事故发生过程和责任有清晰认识，自愿就赔偿事宜达成一致。
内容合法且不违背公序良俗：
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公共秩序和善良风俗。赔偿金额、方式等条款需符合法律规定，不能损害国家、集体或第三人的合法权益。
符合法定形式：
- 虽然法律未强制要求交通事故协议必须采用特定形式，但书面协议更为稳妥。书面协议能清晰记录双方的权利和义务，避免日后因口头协议内容模糊而引发纠纷。
二、协议可能无效或可撤销的情形
存在重大误解：
- 如一方对事故的真实情况（如责任认定、损失程度）存在重大误解而签订协议，该协议可能被认定为可撤销。受损方有权在知道或应当知道撤销事由之日起一年内请求法院或仲裁机构撤销协议。
显失公平：
- 若协议内容明显对一方不公平，且这种不公平非基于双方自愿和合理协商，受损害方可请求法院或仲裁机构变更或撤销协议。例如，赔偿金额远低于实际损失，且非基于双方自愿达成。
欺诈、胁迫手段订立：
- 一方以欺诈、胁迫手段使对方在违背真实意思的情况下订立协议，受欺诈、胁迫方有权请求撤销该协议。例如，一方伪造证据或威胁对方签订不公平的协议。
违反法律法规强制性规定：
- 协议内容若违反法律、行政法规的强制性规定，则该协议无效。例如，约定逃避交警部门责任认定或保险理赔的条款因违法而无效。
三、法律建议
签订前充分了解事故情况：
- 在签订协议前，双方应充分了解事故的真实情况，包括责任认定、损失程度等，以确保协议内容的真实性、合法性及公平性。
尽量采用书面形式：
- 书面协议能清晰记录双方的权利和义务，避免日后纠纷。在签订书面协议时，应详细载明事故的基本事实（时间、地点、经过等）及赔偿事宜（赔偿项目、金额、支付方式、期限等）。
谨慎对待协议内容：
- 在签订协议时，双方应仔细阅读协议内容，确保没有遗漏或误解。如有疑问或不确定之处，应及时向专业人士咨询。
情况变化时及时协商调整：
- 若协议签订后情况发生重大变化（如一方伤势比预想严重很多），双方可协商调整协议内容，或通过法律途径解决争议。
示例说明：
假设甲和乙在交通事故中发生碰撞，双方经协商后签订了一份书面协议，约定甲赔偿乙医疗费、误工费等共计5000元。若该协议满足上述合法有效的条件（如双方具有民事行为能力、意思表示真实、内容合法且不违背公序良俗、符合法定形式），则该协议是合法有效的。然而，若事后发现乙的伤势比预想严重很多，实际损失远超5000元，且这种不公平非基于双方自愿和合理协商，则乙有权请求法院或仲裁机构变更或撤销该协议。
总之，交通事故中和对方司机签订的协议是否合法有效需根据具体情况判断。在签订协议时，双方应确保满足合法有效的条件，并谨慎对待协议内容。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。