结论：投标人占招标人6%的股份是否可以参加投标，需分情况讨论，关键在于是否构成“关联关系”或存在利益冲突，以及是否违反招标文件的禁止性规定。

1. 若招标文件明确禁止关联方投标，则不可参加
   根据《招标投标法实施条例》第三十四条，与招标人存在“可能影响招标公正性的利害关系”的法人、其他组织或个人，不得参加投标。若招标文件明确将“持有招标人一定比例股份”列为禁止情形（例如明确禁止持有5%以上股份的投标人参与），则持有6%股份的投标人因违反招标文件规定，不得参加投标。

2. 若招标文件未禁止，但构成“关联关系”且可能影响公正性，仍可能被禁止
   即使招标文件未明确禁止，若投标人与招标人存在《公司法》定义的关联关系（如一方控制另一方、共同受第三方控制等），或实际存在利益输送、操纵招标结果的风险，监管部门或评标委员会可能依据《招标投标法》第六条“公平、公正原则”认定其投标无效。例如，若6%股份的股东为招标人控股股东的关联方，可能被认定为影响公正性。

3. 若不构成关联关系且无利益冲突，可参加投标
   若6%股份比例较低（如未达到控股、参股影响决策的程度），且投标人与招标人无其他关联关系（如无共同董事、高管，无业务往来等），同时招标文件未禁止此类情形，则投标人可依法参加投标。但需注意，投标人需在投标文件中主动披露持股情况，避免隐瞒导致后续合同无效或行政处罚。

建议：

• 优先核查招标文件是否对关联方投标有明确限制；
  
• 若无限制，进一步评估持股是否构成实质性关联关系或利益冲突；
  
• 必要时咨询招标人或监管部门确认资格，或通过法律程序提出异议。
  

如有具体招标文件条款或持股背景需进一步分析，可直接向我咨询。