结论：合同诈骗中约定的违约赔偿，在特定情况下可以算作损失，但需根据合同效力及诈骗行为的具体情况来判断。以下从不同角度详细分析：
一、合同有效情况下的违约赔偿
合同效力未受影响：若合同诈骗行为尚未导致合同被撤销或认定无效，合同在撤销前仍视为有效。在此期间，若诈骗方违反合同约定（如未按约定交付货物或服务），则需承担违约责任，包括支付违约金和赔偿损失。
违约赔偿作为损失：在合同有效的情况下，违约赔偿是诈骗方因违反合同约定而需向受害方支付的款项。这部分款项可以视为受害方因诈骗行为而遭受的直接经济损失之一，因此，在合同诈骗案件中，约定的违约赔偿可以算作损失。
二、合同无效情况下的损失赔偿
合同因诈骗无效：若合同因诈骗行为被认定无效（如以非法占有为目的的虚构事实、隐瞒真相），则合同自始无效。在此情况下，违约责任以合同有效为前提，因此合同无效时不存在违约责任。
过错方需赔偿损失：尽管合同无效，但过错方（如诈骗方）仍需承担因合同无效给对方造成的损失赔偿责任。这种损失赔偿包括直接损失和间接损失，如因诈骗行为导致的财产损失、预期利益损失等。此时，虽然约定的违约赔偿条款因合同无效而不再适用，但受害方仍可以要求诈骗方赔偿实际损失，包括原本可能通过违约赔偿获得的金额（如果该金额合理且与实际损失相符）。
三、法律责任的重叠与独立
刑事责任与民事责任的独立性：合同诈骗行为不仅可能构成犯罪，需承担刑事责任，还可能同时引发民事责任。即使诈骗方承担了刑事责任，也不影响受害方通过民事诉讼要求其赔偿损失。
全面补偿原则：在处理合同诈骗案件时，应遵循全面补偿原则，确保受害方因诈骗行为而遭受的所有损失都能得到合理赔偿。这包括直接经济损失和间接经济损失，以及原本可能通过违约赔偿获得的金额（在合理范围内）。
四、实际案例与法律适用
案例说明：假设甲与乙签订了一份买卖合同，约定甲向乙出售一批货物，并约定了违约赔偿条款。后甲以非法占有为目的，虚构货物存在的事实，骗取了乙的货款后逃匿。在此情况下，若乙尚未行使撤销权，合同在撤销前仍视为有效。甲的行为既构成合同诈骗，也违反了合同约定。乙可以要求甲支付违约金并赔偿损失（包括货款本金及利息等）。若合同因诈骗被认定无效，乙则无法要求甲支付违约金，但仍可以要求甲赔偿实际损失（包括货款本金及可能产生的其他合理费用）。
法律适用：在处理此类案件时，应依据《中华人民共和国民法典》中关于合同效力、违约责任及损失赔偿的规定，以及《中华人民共和国刑法》中关于合同诈骗罪的规定来综合判断。
建议：若您遭遇合同诈骗并涉及违约赔偿问题，建议及时收集相关证据（如合同、付款凭证、沟通记录等），并咨询专业律师以获取针对性的法律建议。作为专注于合同纠纷领域的律师，我可以为您提供详细的法律分析和维权方案。