将医疗器械经营企业的经营场所和库房用作他用，通常可以视为擅自变更，但具体是否构成违规还需结合相关法规及实际情况来判断。以下从几个方面进行详细分析：

1. 法规依据：

   • 根据《医疗器械经营监督管理办法》等相关法规，医疗器械经营企业应当按照医疗器械经营质量管理规范的要求，建立覆盖质量管理全过程的经营管理制度，并保证经营条件和经营行为持续符合要求。这其中包括对经营场所和库房的专用性要求，即这些场所应当专门用于医疗器械的经营和储存，不得擅自改变其用途。

2. 擅自变更的认定：

   • 如果企业未经相关部门批准，擅自将经营场所或库房用于其他非医疗器械经营相关的活动，如出租、改作他用等，这通常会被视为擅自变更。这种变更可能影响到医疗器械的经营质量和安全，因此是法规所禁止的。

3. 可能的法律后果：

   • 一旦被发现擅自变更经营场所或库房的用途，企业可能面临监管部门的处罚，包括但不限于警告、罚款、责令整改等。在严重情况下，甚至可能被吊销医疗器械经营许可证，从而影响企业的正常经营。

4. 实际操作建议：

   • 合规性审查：企业应定期对自身的经营场所和库房进行合规性审查，确保它们符合相关法规的要求。
   • 及时报备：如果企业确实需要改变经营场所或库房的用途，应提前向相关部门进行报备，并按照规定的程序办理变更手续。
   • 加强管理：企业应加强对经营场所和库房的管理，确保它们始终处于良好的状态，并符合医疗器械经营的质量管理要求。

举例说明：假设某医疗器械经营企业将其库房的一部分改造成了员工休息区，且未向相关部门进行报备。这种行为就可能被视为擅自变更库房的用途，从而面临监管部门的处罚。因此，企业在经营过程中应严格遵守相关法规，确保经营场所和库房的专用性。

综上所述，将医疗器械经营企业的经营场所和库房用作他用，通常构成擅自变更，并可能带来严重的法律后果。因此，我建议企业在经营过程中务必遵守相关法规，确保经营活动的合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。