在实体店购买商品时交付的定金是否会被扣除，主要取决于合同的具体约定以及卖方是否构成违约。以下从不同情况为你详细分析：

1. 合同正常履行：

   • 如果买卖双方按照合同约定正常履行了各自的义务，即买方支付了剩余款项并取走了商品，卖方交付了符合合同约定的商品，那么定金通常会作为价款的一部分或者按照合同约定进行处理，一般不会被额外扣除。

2. 买方违约：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果买方在支付定金后，无正当理由拒绝支付剩余款项或拒绝接收商品，构成违约的，卖方有权不退还定金。这是因为定金在一定程度上具有担保合同履行的作用，买方违约时，定金作为对卖方的一种补偿。
   • 举例：假设你在实体店看中了一件商品，并支付了1000元作为定金，约定一周后支付剩余款项并取货。但一周后你改变了主意，决定不买了。这时，卖方有权根据合同约定不退还你这1000元定金。

3. 卖方违约：

   • 如果卖方在收到定金后，无法按照合同约定交付商品或者交付的商品不符合合同约定，构成违约的，卖方不仅需要退还定金，还可能需要根据买方的损失情况支付额外的赔偿。
   • 举例：同样是你支付了1000元定金购买商品，但一周后卖方告诉你商品已经售罄，无法交付。这时，卖方不仅需要退还你这1000元定金，还可能需要赔偿你因等待商品而产生的其他损失，如交通费、时间成本等（具体赔偿金额需根据实际情况和合同约定确定）。

4. 合同未明确约定：

   • 如果买卖双方在合同中没有明确约定定金的处理方式，或者约定不明确，那么定金的处理将依据相关法律法规和交易习惯进行。在这种情况下，如果发生争议，可能需要通过法律途径解决。

建议：

• 在支付定金前，务必仔细阅读合同条款，特别是关于定金的处理方式、违约责任等关键内容。
• 如果对合同条款有疑问或不确定的地方，及时向卖方咨询并要求解释清楚。
• 保留好合同和支付定金的凭证，以便在发生争议时作为证据使用。

如果你在实体店购物过程中遇到了定金被扣除的争议，或者对合同条款有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。