结论：法人代表但不是股东的情况下，法院冻结其个人账户是否违法，需根据具体情况判断，若冻结行为缺乏法律依据或程序违法，则可能构成违法；反之，若符合法定条件和程序，则不违法。以下从不同角度详细分析：
一、法院冻结账户的法律依据与程序
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院在执行过程中有权冻结被执行人的财产，包括银行账户。这一权力行使的前提是：
- 存在有效的执行依据：如生效的判决书、裁定书、调解书等，明确被执行人需履行特定义务（如支付款项）。
- 被执行人未履行义务：在法定期限内，被执行人未主动履行生效法律文书确定的义务。
- 冻结程序合法：法院需依法作出冻结裁定，并送达被执行人及协助执行单位（如银行）。
若法人代表的个人账户被冻结，但法院未满足上述条件（如无执行依据、未履行通知程序等），则冻结行为可能违法。
二、法人代表与股东身份对冻结的影响
法人代表的责任范围：
- 法人代表是公司的对外代表，其个人财产原则上与公司财产分离。
- 除非法人代表存在滥用职权、损害公司利益等行为（如抽逃出资、挪用资金），或对公司债务承担连带责任（如个人担保），否则其个人账户不应被冻结以清偿公司债务。
股东的责任范围：
- 股东以其出资额为限对公司债务承担有限责任（除非存在人格混同、未履行出资义务等例外情形）。
- 若法人代表同时是股东，且已足额出资，其个人账户仍不应被冻结用于清偿公司债务。
关键点：法院冻结法人代表账户需有明确法律依据，如法人代表个人对公司债务承担连带责任，或其账户资金与公司财产混同且用于公司经营等。
三、可能违法的情形
- 无执行依据冻结：法院未取得生效法律文书，或文书未明确法人代表需承担责任，即冻结其账户。
- 超范围冻结：冻结金额超过被执行人需履行的义务范围。
- 程序违法：未依法送达冻结裁定，或未通知被执行人陈述、申辩权利。
- 误冻：因信息错误（如姓名、账号混淆）冻结无关人员账户。
若存在上述情形，法人代表可依法提出执行异议，要求法院撤销冻结裁定。
四、法律建议
- 核实冻结依据：要求法院提供冻结裁定书及执行依据，确认是否涉及个人责任。
- 提出异议：若认为冻结违法，可在收到裁定书后10日内向法院提出书面异议，并附相关证据（如出资证明、无担保承诺等）。
- 申请复议：对异议裁定不服的，可在15日内向上一级法院申请复议。
- 诉讼救济：若冻结造成损失，可另行起诉要求赔偿。
示例：若法人代表仅因公司债务被冻结账户，但无个人担保或滥用职权行为，可向法院提交公司章程、出资证明等材料，证明其个人财产与公司独立，要求解冻。
五、进一步思考
- 公司人格否认：若法人代表与公司财产混同，债权人可主张“刺破公司面纱”，要求法人代表承担连带责任。此时冻结账户可能合法。
- 刑事责任：若法人代表涉嫌犯罪（如职务侵占、挪用资金），公安机关可依法冻结其账户，与民事执行无关。
总结：法人代表账户被冻结是否违法，需结合冻结依据、程序及责任范围综合判断。建议及时咨询专业律师，通过法律途径维护权益。如有具体案情，可直接向我咨询，我将提供详细分析。