结论：你和你朋友因电子烟被抓，但朋友已出来而手机还在检察院，这种情况可能涉及多个法律环节和因素，包括电子烟的性质、案件的调查进展以及检察院的审查流程等。以下是对此情况的详细分析：
一、电子烟的性质与法律后果
电子烟是否含违禁成分：
- 如果电子烟中含有毒品成分（如大麻油等），则可能构成毒品犯罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，走私、贩卖、运输、制造毒品，无论数量多少，都应当追究刑事责任，予以刑事处罚。
- 如果电子烟仅含有普通尼古丁成分，且你们没有其他违法行为（如向未成年人销售等），则一般不构成犯罪，但可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
共同行为的影响：
- 如果你和你朋友共同持有或使用含有违禁成分的电子烟，且你们对此都有明知，那么你们可能共同构成犯罪。在这种情况下，即使你朋友已经出来，也不代表案件已经结束，你可能仍需接受调查或面临法律后果。
二、案件的调查进展
调查阶段：
- 案件可能仍处于调查阶段，检察院正在收集证据、审查案件事实。在这个过程中，你朋友的释放可能只是暂时的，或者他可能因证据不足、情节轻微等原因被取保候审或监视居住。
- 你的手机作为可能的证据之一，可能被检察院扣押以进行进一步调查。这并不意味着你一定有罪，而是检察院在依法履行其调查职责。
调查期限：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，检察院对案件的调查期限是有限的。但是，在复杂案件中，调查期限可能会延长。因此，手机被扣押的时间也可能相应延长。
三、检察院的审查流程
审查起诉：
- 检察院在调查结束后，会根据案件事实和法律规定决定是否提起公诉。如果检察院认为证据不足或情节轻微，可能会作出不起诉决定；如果认为构成犯罪，则会向法院提起公诉。
- 在这个过程中，你的手机作为证据之一，可能会被用于证明案件事实。如果手机中的内容与案件无关或不足以证明犯罪，检察院可能会在审查结束后归还手机。
手机扣押的合法性：
- 检察院扣押手机必须依法进行，并出具相应的法律文书。如果你对手机扣押的合法性有疑问，可以要求检察院出示相关法律文书或咨询专业律师。
四、建议与行动
配合调查：
- 在案件调查期间，建议你积极配合检察院的调查工作，如实陈述事实、提供证据。这有助于加快案件的调查进度，并可能减轻你的法律责任。
咨询律师：
- 如果你对案件的法律后果、调查进展或检察院的审查流程有疑问，建议及时咨询专业律师。律师可以根据你的具体情况提供法律建议和帮助，维护你的合法权益。
关注手机归还情况：
- 你可以关注手机被扣押的进展情况，并在适当的时候向检察院询问手机是否可以归还。如果检察院认为手机与案件无关或已调查完毕，应该会及时归还给你。
五、可能面临的法律后果
- 如果电子烟中含有毒品成分且你构成犯罪，你可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或管制等。
- 如果电子烟仅含普通尼古丁成分且你没有其他违法行为，你可能不会面临刑事处罚，但可能面临行政处罚。
- 无论哪种情况，你都应该积极配合调查工作，并咨询专业律师以了解你的法律权利和义务。
最后，我理解你现在可能非常担心和焦虑，但请保持冷静和理性。案件的处理需要时间和程序，你需要耐心等待并积极配合。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。