挂靠公司资质在绝大多数情况下是不合法的，这一结论基于我国多项法律法规的明确规定，并可能导致严重的法律后果。以下是对此问题的详细分析：
一、挂靠公司资质的违法性
《中华人民共和国建筑法》的禁止性规定：
- 该法明确规定，承包建筑工程的单位应持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。严禁建筑施工企业以任何形式允许其他单位或个人使用本企业的资质证书、营业执照承揽工程。挂靠行为本质上就是违反此规定，让无资质者借壳参与经营。
《中华人民共和国行政许可法》的相关规定：
- 该法规定，被许可人以不正当手段取得行政许可的，将受到行政处罚；未经行政许可擅自从事应取得行政许可活动的，同样将受罚。挂靠行为往往涉及伪造或借用资质证书，属于不正当手段取得行政许可的范畴。
《中华人民共和国刑法》的刑事责任规定：
- 对于违反国家规定，未经许可经营专营、专卖物品或限制买卖物品，扰乱市场秩序且情节严重的，将处以刑罚。挂靠行为若导致严重后果，如工程质量问题、安全事故等，可能触犯刑法，构成犯罪。
二、挂靠行为的危害与风险
扰乱市场秩序：
- 挂靠导致不具备资质的主体参与竞争，损害合法企业利益，破坏公平竞争环境。这不利于行业的健康发展，也可能引发更多的违法行为。
工程质量隐患：
- 无资质主体承接工程可能因技术、管理等方面的不足而引发质量问题，危及公共安全。一旦发生事故，挂靠者和被挂靠者都可能承担严重的法律责任。
法律责任风险：
- 被挂靠企业需对挂靠者行为承担连带责任，包括违法行为导致的赔偿等。这意味着，即使被挂靠企业并未直接参与挂靠行为，也可能因挂靠者的违法行为而遭受损失。
财务风险：
- 挂靠者可能以被挂靠企业名义进行金融活动，如贷款、融资等，带来财务损失和税务风险。这些风险可能由被挂靠企业承担，影响其正常经营和信誉。
三、特殊情形下的考量
尽管在特定历史时期或政策背景下，可能存在一些特殊的挂靠安排并得到一定程度认可，但这种认可通常具有条件性和期限性，且随政策调整而变化。因此，不能作为普遍依据来主张挂靠的合法性。在现行法律框架下，挂靠行为仍然是被严格禁止的。
四、挂靠公司资质的法律后果
合同无效：
- 挂靠公司所签订的工程合同或其他经营合同自始不具有法律效力。这意味着，一旦发生纠纷，合同双方将难以通过法律途径维护自身权益。
行政处罚：
- 挂靠双方可能面临罚款、吊销资质证书等处罚。这些处罚不仅会影响企业的正常经营，还可能对其声誉造成严重影响。
刑事责任：
- 如果挂靠行为构成犯罪，将依法追究刑事责任。这可能导致企业负责人或相关责任人员面临牢狱之灾，对企业和家庭造成巨大打击。
税务与社保问题：
- 挂靠公司在税务和社保方面若存在违规行为，也将面临相应的法律后果。这包括补缴税款、滞纳金、罚款等，甚至可能影响企业的税务信用等级。
建议：企业和个人在承接工程或进行其他经营活动时，务必遵守相关法律法规，远离挂靠等违法行为。对于确实需要合作的情况，应寻求合法的合作方式和途径，如通过合法招标、联合体投标等方式进行合作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。