在第二轮土地证合并的情况下，第三轮土地延包时土地证能否分开，需分情况讨论，具体如下：

1. 若第二轮土地合并有合法依据且未改变土地承包关系本质
   根据《农村土地承包法》第二十四条，土地承包经营权证是承包方享有土地承包经营权的法律凭证。若第二轮土地合并是基于家庭内部协商（如兄弟分家）、村集体调整（需经法定程序）或继承等合法原因，且合并后土地承包关系清晰、权属无争议，第三轮延包时原则上可按实际承包关系重新确权发证。
   关键点：需提供第二轮合并的合法依据（如分家协议、村集体调整记录、继承公证等），并确保第三轮延包程序符合《农村土地承包法》第二十八条（家庭承包方案需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或代表同意）。

2. 若第二轮土地合并存在程序瑕疵或权属争议
   若合并行为未履行法定程序（如未经村集体同意、未签订书面合同），或存在纠纷（如合并后一方反悔、其他家庭成员主张权利），第三轮延包时需先解决争议。根据《农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》，可通过协商、调解、仲裁或诉讼明确权属后，再申请分开确权。
   关键点：争议解决前，土地证可能无法分开；需保留合并时的相关证据（如证人证言、付款记录等）以支持主张。

3. 地方政策对土地延包的具体规定
   部分地区可能出台了关于土地延包的细化政策（如“大稳定小调整”原则）。例如，若地方规定“延包时原则上维持现有承包关系不变”，则即使第二轮合并，第三轮也可能维持合并状态；若允许“因人口变动调整”，则可能支持分开。
   建议：向当地农业农村局或乡镇政府咨询具体政策，或查阅本省《农村土地承包条例》等地方性法规。

行动建议：

• 梳理第二轮土地合并的依据（合同、协议、村集体记录等）；
  
• 向村集体或乡镇政府了解第三轮延包的政策导向；
  
• 若存在争议，及时通过调解或诉讼明确权属，避免延误延包登记。
  

如有进一步细节（如合并原因、当地政策等），可补充说明后继续分析。