结论：公务员退休3年后，在遵守相关法律法规的前提下，可以经营与原职务不直接相关的公司。

详细分析：

1. 法律依据与限制期限：

   • 根据《中华人民共和国公务员法》第一百零七条，公务员退休后，原系领导成员、县处级以上领导职务的公务员在离职三年内，其他公务员在离职两年内，不得到与原工作业务直接相关的企业或者其他营利性组织任职，也不得从事与原工作业务直接相关的营利性活动。这一规定旨在防止公务员利用在职期间积累的资源进行不公平的商业竞争。
   • 既然您已经退休3年，且假设您原系领导成员或县处级以上领导职务（若非此类职务，则限制期更短，为两年），那么您已经超过了法律规定的限制期限。

2. 经营公司的合法性：

   • 在超过限制期限后，您可以依法申请注册公司，并前往工商部门办理营业执照，开展正常的商业活动。但前提是，您所经营的公司业务不得与原工作业务直接相关。例如，如果您原在税务部门工作，那么退休后短期内不得开办税务代理公司，但开设一家与税务无关的公司，如餐饮、零售等，则是被允许的。
   • 在经营过程中，您必须严格遵守国家相关法律法规，如公司法、税法等，确保公司的合法合规运营。

3. 潜在的法律风险与防范：

   • 尽管您已经超过了限制期限，但在经营公司时仍需谨慎，避免涉及任何与原工作业务直接相关的活动，以免引发不必要的法律纠纷。
   • 如果您在经营过程中遇到任何法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师，以确保您的经营活动始终在法律框架内进行。

总结与建议： 公务员退休3年后，在遵守相关法律法规的前提下，您有权经营与原职务不直接相关的公司。在经营过程中，请务必确保公司的合法合规运营，并严格遵守国家相关法律法规。如果您在经营过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。