在建设工程司法鉴定过程中，若一方不同意挖地基进行检测，可按以下情况处理：

1. 依据鉴定程序与合同约定处理
   首先需查看司法鉴定委托书、建设工程合同中是否明确约定了检测方式（包括是否需挖地基）及争议解决条款。若合同或鉴定程序已明确要求挖地基检测，且该程序符合《建设工程司法鉴定程序规范》等法规要求，则不同意方可能构成“不配合鉴定”的违约行为。此时可向法院申请强制执行鉴定程序，或由法院直接认定其阻碍行为导致鉴定无法完成的法律后果（如推定对方主张不成立）。

2. 通过协商或补充证据替代检测
   若合同未明确检测方式，或挖地基可能对建筑物造成不可逆损害，可尝试与对方协商采用无损检测技术（如地质雷达、钻孔取芯等）替代挖地基。若协商无果，需及时固定其他证据（如施工记录、监理日志、前期检测报告等），证明地基质量符合标准，降低对挖地基检测的依赖。

3. 申请法院介入裁决
   若对方无正当理由拒绝挖地基检测，可向法院提交书面申请，说明检测的必要性（如涉及结构安全、质量争议核心等）及对方阻碍行为的具体表现。法院可能通过以下方式处理：

   • 责令对方配合检测，并明确拒不配合的法律后果（如罚款、拘留或直接采纳己方证据）；
     
   • 委托第三方机构评估挖地基检测的合理性，若评估认为必要，则强制执行；
     
   • 在检测无法实施时，根据现有证据综合判断责任归属。

实务建议：

• 提前在合同中明确鉴定条款，包括检测方式、费用承担及拒不配合的处理方式；
  
• 检测前向对方送达书面通知，留存送达证据（如签收记录、公证送达）；
  
• 若对方持续阻挠，可同步准备工程质量鉴定替代方案（如分阶段检测、专家论证），避免程序停滞。
  

如有进一步细节（如合同条款、阻挠具体行为等），可向我补充说明，我会结合案例为您分析具体应对策略。