作为拥有多领域法律实务经验的律师，针对您提出的“控股股东申请破产清算我的股票怎么办”这一问题，核心结论如下：
股票可能面临的价值变动风险
控股股东申请破产清算，通常意味着其资产将被清算以偿还债务。若控股股东持有上市公司大量股份，这些股份可能被纳入破产财产进行拍卖或转让。此时，市场对公司的信心可能下降，导致股价波动甚至下跌，您的股票价值可能因此缩水。
建议：密切关注公司公告及市场动态，评估控股股东破产对公司的实际影响（如业务连续性、管理层稳定性等），必要时可咨询财务顾问分析股票价值变化趋势。
股东权益的受偿顺序问题
在破产清算中，债权人的清偿优先级高于股东。控股股东的债权人（如银行、供应商）将优先获得资产分配，剩余财产（如有）才会分配给股东。若控股股东为有限责任公司股东，其个人破产通常不影响公司其他股东的权益；但若控股股东是公司本身（如母公司破产），则可能间接影响子公司运营，进而波及您的股东权益。
建议：查阅公司章程及破产清算公告，确认控股股东的破产是否涉及公司资产被划转或抵押，以及您作为股东的受偿顺序（如有）。
信息披露与知情权保护
根据《公司法》及《证券法》，上市公司需及时披露控股股东破产等重大事项。若公司未依法披露，您可通过股东大会或诉讼途径主张权利。此外，您有权要求公司说明破产对经营的具体影响及应对措施。
建议：若发现信息披露违规，可向证监会或交易所举报；若需进一步了解公司应对方案，可书面要求董事会或监事会召开说明会。
股票转让或回购的可能性
若控股股东破产导致公司控制权变更，新控股方可能提出股票回购或要约收购。此外，若公司因控股股东破产陷入经营困境，符合条件的股东可依据《公司法》第182条请求法院解散公司（但实践中难度较高）。
建议：关注公司是否发布回购公告或要约收购文件，评估回购价格是否合理；若公司长期无法正常经营，可联合其他股东探讨解散公司的可行性。
总结：控股股东破产清算对股票的影响需结合公司性质、破产原因及市场反应综合判断。建议您优先通过公司公告、财报等官方渠道获取信息，必要时委托专业机构评估股票价值及风险。若涉及具体操作（如诉讼、回购谈判），可进一步向我提供细节，我将为您制定针对性方案。