支付劳动仲裁调解协议约定款项是否需要报税，这主要取决于款项的性质。以下是对这一问题的详细分析：

1. 如果款项属于工资、薪金所得：

   • 根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资、薪金所得属于个人所得税的征税范围。因此，如果劳动仲裁调解协议中约定的款项是工资、薪金性质的，如未支付的工资、加班费、奖金等，那么这部分款项在支付时是需要按照个人所得税法规定进行纳税的。
   • 具体操作：支付方（通常是用人单位）在支付这些款项时，需要代扣代缴个人所得税，并将税款上缴至税务机关。

2. 如果款项属于经济补偿或赔偿：

   • 对于因解除劳动合同而支付的经济补偿金，根据现行税法规定，在一定额度内（通常是当地上年职工平均工资3倍数额以内）是免征个人所得税的。超过这个额度的部分，则需要按照“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。
   • 如果是因劳动纠纷而支付的赔偿金，且该赔偿金不属于工资、薪金性质的，那么其税务处理可能会根据具体情况有所不同。一般来说，如果赔偿金是针对个人受到的损失或伤害进行的补偿，且不属于常规的工资、薪金范畴，那么可能不需要缴纳个人所得税。但具体还需根据税务机关的解释和判断来确定。
   • 特殊情况：如果劳动仲裁调解协议中明确约定了赔偿金的税务处理方式，或者双方对税务处理有特别约定，那么应按照约定来执行。

3. 其他注意事项：

   • 在支付劳动仲裁调解协议约定款项时，建议双方明确款项的性质和税务处理方式，以避免后续出现税务纠纷。
   • 如果对税务处理存在疑问或不确定，可以咨询当地税务机关或专业税务顾问的意见。

总结与建议：

• 支付劳动仲裁调解协议约定款项是否需要报税，主要取决于款项的性质。如果是工资、薪金所得或超过免税额度的经济补偿金，则需要缴纳个人所得税；如果是特定情况下的赔偿金且不属于工资、薪金性质，则可能不需要缴纳。
• 在处理这类问题时，建议双方明确约定款项的性质和税务处理方式，并在必要时咨询专业税务顾问的意见，以确保合规性和避免潜在风险。

如有任何进一步疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。