在交通事故中，当电瓶车主责、机动车次责，且机动车只交了交强险的情况下，赔偿问题需要依据责任比例、具体损失以及相关法律法规来综合确定。以下是对此问题的详细解答：

一、责任比例与认定

1. 责任比例：

   • 通常情况下，电瓶车主责会承担70%左右的赔偿责任，而机动车次责则承担30%左右的赔偿责任。但具体比例可能因地区和案情有所调整，最终由交警部门出具的责任认定书明确。

2. 责任认定流程：

   • 事故发生后，交警部门会进行现场勘查、询问当事人等，根据事故现场情况、双方行为对事故发生的作用以及过错的严重程度，出具交通事故责任认定书。

二、交强险赔偿阶段

1. 交强险责任限额：

   • 医疗费用赔偿限额：18000元（包括医药费、诊疗费等）。
   • 伤残赔偿限额：180000元（包括丧葬费、残疾赔偿金等）。
   • 财产损失赔偿限额：2000元。

2. 赔偿方式：

   • 先由机动车的交强险在上述限额内对电瓶车方进行赔付。例如，如果电瓶车方有医疗费用损失，交强险会先赔付最多18000元；如果有财产损失，交强险会先赔付最多2000元。

三、超出交强险部分的赔偿

1. 人身损害赔偿：

   • 包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住院伙食补助费、营养费、残疾赔偿金、精神损害抚慰金等。
   • 超出交强险限额的部分，按责任比例分担。例如，总医疗费用为50000元，交强险已赔18000元，超出的32000元，机动车方承担30%（即9600元），电瓶车方承担70%（即22400元）。

2. 财产损害赔偿：

   • 如电瓶车或机动车的维修费用，超出交强险财产损失赔偿限额2000元的部分，同样按责任比例分担。

四、电瓶车方对机动车方损失的赔偿

• 如果机动车在事故中也有损失，电瓶车方需按照责任比例赔偿。例如，机动车维修费用为8000元，电瓶车方需赔偿70%（即5600元）。

五、赔偿流程与注意事项

1. 赔偿流程：

   • 责任认定：由交警部门出具交通事故责任认定书。
   • 损失评估：双方可协商或委托第三方机构对损失进行评估。
   • 交强险赔付：机动车方先向保险公司申请交强险赔付。
   • 协商赔偿：双方根据责任比例和损失情况协商赔偿金额。
   • 法律途径：若协商不成，可通过法律途径解决，如向法院提起诉讼。

2. 注意事项：

   • 尽快与对方及保险公司沟通协商，防止后续纠纷。
   • 赔偿金额需根据实际损失和责任比例确定，并了解当地法律规定。
   • 保留好相关证据，如事故现场照片、医疗费用单据、维修费用发票等。
   • 若涉及人员伤残或重大财产损失，建议咨询专业律师以获取更准确的法律建议。

综上所述，当电瓶车主责、机动车次责，且机动车只交了交强险时，赔偿问题需根据明确的责任比例、具体的损失情况以及相关法律法规来综合确定。双方应积极沟通协商，并遵循合理的赔偿流程和注意事项来确保双方权益得到妥善处理。