若车辆没有违法却被当地政府扣车，你可以按照以下步骤处理：

1. 核实扣车依据与程序
   首先，要求扣车部门（如交警、城管等）出具书面扣车凭证，明确扣车依据的法律条款（如《道路交通安全法》《行政强制法》等）及具体事由。若对方无法提供合法依据或程序违法（如未出示证件、未告知权利义务），可初步判断扣车行为可能存在瑕疵。

2. 提出书面异议并申请复议
   根据《行政强制法》第十八条，行政机关实施扣押需当场告知当事人权利义务。若程序违法，可在收到扣车凭证后60日内向扣车部门的上级机关或同级政府申请行政复议，要求撤销扣车决定并返还车辆。复议申请需写明事实、理由及诉求，并附扣车凭证等证据。

3. 提起行政诉讼作为最终救济
   若复议未获支持或扣车部门未答复，可在知道扣车行为之日起6个月内向法院提起行政诉讼，请求确认扣车行为违法并赔偿损失（如车辆停运损失、折旧费等）。诉讼中需重点举证扣车行为无合法依据或程序严重违法。

4. 特殊情形处理

   • 误扣车辆：若因信息错误（如车牌套用）被扣，需立即向扣车部门说明情况，并提供行车记录、监控等证据证明自身清白，要求尽快放车。
     
   • 紧急情况：若扣车导致重大损失（如急救车辆被扣），可依据《行政强制法》第五十九条申请法院立即裁定停止执行，避免损失扩大。

温馨提示：处理过程中需注意保留所有书面材料（扣车凭证、复议申请回执、诉讼材料等），并避免与扣车人员发生冲突。若对法律程序不熟悉，可直接向我咨询具体操作细节。