针对您提出的“基本农田违规办证怎么处罚”的问题，这实际上涉及到非法占用或违规使用基本农田的行政处罚情况。虽然直接针对“违规办证”的处罚流程可能并未在提供的参考信息中明确提及，但我们可以根据非法占用或改变基本农田用途的相关行政处罚来推断可能的处理方式和原则。

首先，需要明确的是，基本农田是受到严格保护的，任何未经批准擅自改变其用途或进行非法建设的行为都是违法的。对于这类行为，通常会由县级以上人民政府的土地行政主管部门（如市土地执法监察大队）进行查处。

处罚原则与流程：

1. 调查取证：土地行政主管部门在接到举报或发现违法行为后，会进行调查取证，确认违法事实、性质、情节以及社会危害程度。

2. 责令改正：对于违规办证或非法占用基本农田的行为，土地行政主管部门通常会首先责令违法者停止违法行为，并限期改正，如拆除违法建筑、恢复土地原状等。

3. 行政处罚：如果违法者未在规定期限内改正，土地行政主管部门将依法给予行政处罚。处罚措施可能包括罚款、没收违法所得、责令限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施等。对于情节严重的，还可能涉及刑事责任。

4. 申请强制执行：如果违法者拒不履行行政处罚决定，土地行政主管部门可以依法申请人民法院强制执行。

具体到违规办证的情况：

虽然直接针对“违规办证”的处罚可能并未明确提及，但我们可以合理推断，如果办证过程涉及非法占用或改变基本农田用途，那么该办证行为本身就是违法的，且可能作为非法占用土地行为的一部分受到处罚。此外，如果办证是通过欺骗手段获得的，还可能涉及《中华人民共和国土地管理法实施条例》中关于“采取非法手段骗取土地登记、获取土地权属证书”的行政处罚，该条款规定由县级以上人民政府土地行政主管部门责令交还骗取的土地证书，并可能处以罚款。

建议：

如果您或他人发现基本农田被违规办证或非法占用的情况，建议及时向当地土地行政主管部门举报，并提供相关证据。土地行政主管部门将依法进行调查处理，并保护举报人的合法权益。

最后，需要强调的是，保护基本农田是每个人的责任和义务。任何未经批准擅自改变基本农田用途或进行非法建设的行为都将受到法律的严惩。