行贿5%股份认定金额需结合股份实际价值综合判断，具体认定方式如下：

1. 以股份的公允市场价值认定
   若股份属于上市公司或可公开交易的股份，通常以行贿行为发生时该股份的市场交易价格作为认定依据。例如：行贿时某上市公司股票单价为10元，5%股份对应金额为（公司总股本×5%）×10元。若股份为非上市公司，需通过专业评估机构对股份价值进行评估，以评估报告中的公允价值作为认定基准。

2. 以行贿目的对应的实际利益价值认定
   若行贿人通过股份行贿是为了获取特定项目、合同或政策优惠，且该利益可量化（如项目利润、合同金额等），司法机关可能以行贿人实际获得的利益价值倒推股份价值。例如：行贿人通过股份行贿获得价值500万元的项目，若股份占项目利润的10%，则可能认定行贿金额为50万元（需结合其他证据综合判断）。

3. 以行贿人与受贿人约定的价值认定
   若双方在行贿过程中明确约定了股份价值（如书面协议、口头约定等），且该约定与市场价值无明显偏离，司法机关可能直接采用约定价值作为认定依据。但若约定价值明显低于市场价值，且无合理理由，司法机关可能以市场价值或实际利益价值为准。

4. 特殊情形下的认定规则

   • 股份未实际转让：若行贿人仅承诺给予股份但未实际办理转让手续，可能以“未遂”论处，但若已部分履行（如签订转让协议、支付部分对价），仍可能按已履行部分的价值认定。
     
   • 股份价值波动：若行贿时股份价值与案发时价值差异较大，司法机关可能以行贿行为发生时的价值为准，但若受贿人实际获利时间与行贿时间间隔较长，可能参考获利时的价值。
     
   • 行贿人获利与股份价值不匹配：若行贿人通过股份行贿获得的利益远高于股份本身价值（如通过股份行贿后获得垄断地位），司法机关可能以实际获得的利益价值作为认定基准。

温馨提示：行贿罪的认定需结合具体情节（如行贿目的、手段、后果等），且司法实践中对股份价值的认定可能因案件细节不同而有所差异。若您涉及相关案件，建议提供具体细节（如股份类型、行贿时间、双方约定等），以便进一步分析。