针对代理商门店低价乱价、窜货扰乱市场的情况，你司可以采取以下措施来应对：
合同约束与明确违约责任：
- 首先，检查你司与代理商签订的合同中是否有关于价格控制、窜货管理以及违约责任的具体条款。如果合同中有明确规定代理商不得低价销售或窜货，并且规定了相应的违约责任，那么你司可以依据合同条款向代理商主张权利，要求其停止违规行为，并承担违约责任。
- 如果合同中没有相关条款或条款不够明确，建议尽快与代理商协商补充或修改合同，增加价格控制、窜货管理以及违约责任的具体内容，以便在未来发生类似情况时有明确的法律依据。
发送律师函警告：
- 在确认代理商存在违规行为后，你司可以委托律师向代理商发送律师函，明确指出其违规行为，并要求其立即停止低价销售和窜货行为，否则将采取法律手段追究其责任。律师函通常具有一定的威慑力，能够促使代理商重视并改正违规行为。
提起民事诉讼：
- 如果代理商在收到律师函后仍然继续违规行为，你司可以考虑向法院提起民事诉讼，要求代理商停止侵权行为、赔偿经济损失等。在诉讼过程中，你需要提供充分的证据证明代理商的违规行为以及你司因此遭受的损失。
- 根据《价格违法行为行政处罚规定》和《中华人民共和国价格法》的相关规定，经营者不得以低于成本的价格倾销商品，扰乱正常的生产经营秩序。代理商的低价乱价行为如果构成不正当价格行为，还可能面临行政处罚。虽然行政处罚的直接对象是代理商，但你司可以作为受害者向相关部门举报，并配合调查。
加强市场监管与渠道管理：
- 除了法律手段外，你司还可以加强市场监管和渠道管理，通过定期巡查、建立举报机制等方式，及时发现并制止代理商的违规行为。
- 同时，你司可以与代理商建立更紧密的合作关系，通过提供培训、支持等方式，帮助代理商提高销售能力和市场竞争力，从而减少低价销售和窜货的动机。
考虑终止合作：
- 如果代理商的违规行为严重且屡教不改，你司可以考虑终止与其的合作，并寻找新的合作伙伴。在终止合作前，你需要确保已经采取了所有必要的法律手段来保护自己的权益，并妥善处理与代理商之间的债权债务关系。
在处理此类问题时，你司需要注意以下几点：
- 保留证据：在采取任何行动之前，确保你已经收集并保留了足够的证据来证明代理商的违规行为，如销售记录、价格表、窜货证据等。
- 合法合规：在采取法律手段时，确保你的行为符合相关法律法规的规定，避免因为自身行为不当而引发新的法律纠纷。
- 及时沟通：在处理过程中，保持与代理商的及时沟通，尽量通过协商解决问题，减少不必要的法律冲突和成本。
如果你司在处理此类问题时遇到任何法律难题或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。