结论：老房本上的名字与回迁协议、入住证明上的名字音同字不同，是否可以提出案外异议，需根据具体情况判断，但一般情况下，若能证明三者指向同一人，通常可以提出异议；若无法证明，则可能面临一定困难。以下从不同角度进行分析：

1. 法律关系与证据认定：

   • 在法律上，房屋产权的确认通常依赖于产权证书上的记载。然而，当产权证书上的名字与回迁协议、入住证明上的名字存在音同字不同的情况时，关键在于能否通过其他证据证明这些名字实际上指向的是同一个人。
   • 例如，如果回迁协议和入住证明中详细描述了房屋的位置、面积、回迁原因等信息，且这些信息与老房本上的信息一致，同时辅以身份证号码、户籍证明、邻居或社区的证言等证据，可以形成较为完整的证据链，证明三者指向同一人。

2. 提出案外异议的流程与要求：

   • 若您认为老房本上的名字与回迁协议、入住证明上的名字实际上指向同一人，且该房屋产权存在争议或错误登记，您可以向相关登记机构或法院提出案外异议。
   • 在提出异议时，您需要提交充分的证据材料，包括但不限于回迁协议、入住证明、身份证复印件、户籍证明、邻居或社区的证言等，以证明您的主张。
   • 登记机构或法院将对您的异议进行审查，并根据审查结果作出相应的处理决定。

3. 可能面临的困难与风险：

   • 如果无法提供充分的证据证明老房本上的名字与回迁协议、入住证明上的名字指向同一人，您的异议可能无法得到支持。
   • 即使您提供了充分的证据，但如果登记机构或法院认为这些证据不足以证明您的主张，或者存在其他法律上的障碍（如诉讼时效、善意取得等），您的异议也可能面临被驳回的风险。

4. 建议与措施：

   • 在提出案外异议前，建议您先收集并整理好所有相关的证据材料，确保这些证据材料真实、合法、有效。
   • 如果可能的话，您可以咨询专业的律师或法律机构，以获取更具体的法律建议和帮助。
   • 在提出异议时，务必按照相关登记机构或法院的要求和程序进行操作，以确保您的异议能够得到及时、有效的处理。

总结与进一步思考：老房本上的名字与回迁协议、入住证明上的名字音同字不同，是否可以提出案外异议，取决于您能否提供充分的证据证明三者指向同一人。在处理此类问题时，建议您保持谨慎和耐心，积极收集证据并咨询专业律师的意见。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。