国土储备中心与单位签订国有土地合同在特定情况下是合法的，但其合法性受到严格限制，并且需遵循相关法律法规及程序规定。以下从多个角度进行详细分析：

一、土地储备中心的法律地位与职责

土地储备中心是市、县人民政府批准成立的事业单位，具有独立法人资格，隶属于国土资源管理部门。它主要负责本行政辖区内土地储备工作的统筹和实施，包括储备地和项目用地的征收兑付工作、对已征收储备地进行前期管理等。然而，土地储备中心并不具有征收的行政职权和行政主体资格，这是理解其签约合法性的重要前提。

二、合法签约范围

1. 土地储备相关业务：

   • 在土地征收、收购以及储备土地的前期开发等业务领域内，土地储备中心具有合法的签约资格。例如，它可以与土地所有权人（如农村集体经济组织）或土地使用权人就土地征收、收购事宜签订合同；也可以与施工单位、勘察设计单位等签订前期开发建设合同。

2. 遵循法定程序：

   • 土地储备中心在签约时，必须遵循公开招标、拍卖、挂牌等法定程序规定。如果违反这些程序，所签合同可能面临效力问题。

三、非法签约情况

1. 房屋征收与补偿领域：

   • 根据我国《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定，与被拆迁人签订征收补偿协议的主体应是房屋征收部门，而非土地储备中心。因此，在房屋拆迁或土地征收的补偿环节，土地储备中心不具备直接签约的合法性。

2. 超出法定职权范围：

   • 如果土地储备中心从事与土地储备、开发无关的商业经营类合同签约，或者超出其法定职权范围进行签约，所签合同可能因违法而无效。

四、实际应用中的指导意义

1. 明确职能界限：

   • 在实际操作中，应明确区分土地储备中心与房屋征收部门的职能界限，确保签约主体的合法性。这有助于避免因签约主体不当而引发的法律纠纷。

2. 严格遵守法律法规：

   • 土地储备中心在参与土地储备相关业务时，应严格遵守法律法规及其职权范围，避免越权或违规操作。这有助于维护合同的合法性和有效性。

3. 核实签约资格：

   • 对于被拆迁人或土地使用权人来说，在与相关部门签订合同时，应仔细核实对方的签约资格和权限。这有助于确保自身权益得到有效保障，避免因签约主体不当而遭受损失。

五、法律后果

如果土地储备中心超出其法定职权范围或未遵循法定程序进行签约，所签合同可能面临效力问题。这可能导致合同被撤销、变更或确认无效，从而给签约双方带来不必要的法律风险和经济损失。

总结来说，国土储备中心与单位签订国有土地合同的合法性取决于签约的具体内容、程序以及土地储备中心的法定职权范围。在涉及房屋征收与补偿等领域时，应由具备相应职权的房屋征收部门作为签约主体。如果您在具体操作中遇到相关问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。