合法流转土地并建设房屋需分两步进行，即先完成土地流转的合法手续，再依法办理房屋建设审批，具体如下：
一、土地流转的合法流程
确认土地性质与用途
- 农村集体土地：需区分是宅基地、承包地（耕地/林地）还是集体经营性建设用地。
- 宅基地：仅限本集体经济组织成员内部流转（如村民之间转让），且需符合“一户一宅”原则。
- 承包地：流转需经发包方（村委会）同意，且不得改变农业用途（如耕地不能转为建设用地）。
- 集体经营性建设用地：可通过入市方式流转，但需符合土地利用总体规划和城乡规划。
- 国有土地：需通过出让、转让、租赁等方式取得，且用途需符合《国有土地使用证》记载内容。
签订书面流转合同
- 合同需明确流转方式（出租/转让/入股）、期限、价款、用途及双方权利义务。
- 农村土地流转需报发包方备案；国有土地转让需办理权属变更登记。
办理行政审批或备案
- 农村承包地流转：向乡镇政府备案；宅基地流转需经村委会同意并报乡镇政府审批。
- 集体经营性建设用地入市：需经村民会议三分之二以上成员同意，并报县级政府批准。
- 国有土地转让：需缴纳土地增值税、契税等税费，并办理不动产登记。
二、房屋建设的合法流程
申请建设用地规划许可证
- 向当地规划部门提交土地权属证明、项目可行性报告等材料，申请核发《建设用地规划许可证》，确认土地用途和建设范围。
申请建设工程规划许可证
- 提交房屋设计图纸、施工方案等材料，申请核发《建设工程规划许可证》，确保建筑符合规划要求（如层高、面积、消防通道等）。
办理施工许可与竣工验收
- 施工前需向住建部门申请《建筑工程施工许可证》，并委托有资质的施工单位施工。
- 竣工后需组织规划、消防、环保等部门验收，合格后办理《不动产权证书》。
三、关键风险提示
- 土地用途管制：未经批准擅自改变土地用途（如耕地建房）可能面临拆除、罚款甚至刑事责任。
- 合同效力：流转合同若违反法律强制性规定（如非集体成员受让宅基地）可能被认定无效。
- 权属纠纷：流转前需核查土地是否存在抵押、查封等权利限制，避免后续纠纷。
建议：流转土地或建设房屋前，务必核实土地性质、用途及规划要求，并咨询当地自然资源、规划部门确认流程。如有具体操作疑问，可直接向我提问，我将结合您所在地区的政策进一步分析。