若网贷调解协议已签署且发现退费金额写多了，可按以下步骤处理：

1. 立即联系对方协商修改
   调解协议本质是双方合意，若金额明显超出合理范围（如计算错误、笔误等），可第一时间与网贷平台或调解机构沟通，说明情况并要求重新核对金额。需保留书面沟通记录（如邮件、短信），避免口头协商无凭证。
   法律依据：根据《民法典》第147条，基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或仲裁机构撤销。但需注意，撤销权需在知道撤销事由后90日内行使，且需证明“重大误解”存在（如退费金额与实际应退金额差距显著）。

2. 检查协议是否已生效或履行

   • 若协议未生效（如尚未签字、盖章或未通过调解机构确认）：可直接要求修改金额，重新签订协议。
     
   • 若协议已生效但未履行（如对方尚未退费）：可与对方协商签订补充协议，明确修正后的金额，或通过调解机构出具修正说明。
     
   • 若协议已部分履行（如对方已退部分款项）：需核对已退金额与修正后金额的差额，协商剩余款项的支付方式，并签订书面确认文件。

3. 保留证据以防纠纷
   无论协商结果如何，务必保存以下证据：

   • 原始调解协议（纸质或电子版）；
     
   • 退费金额计算依据（如借款合同、还款记录、利息计算表等）；
     
   • 与对方沟通的记录（如聊天记录、录音、邮件等）；
     
   • 调解机构出具的相关文件（如调解笔录、确认书等）。
     作用：若对方拒绝修改且后续发生争议，这些证据可证明金额错误的事实，支持通过法律途径解决。

4. 若协商无果，可申请司法确认或起诉

   • 司法确认：若调解协议经人民调解委员会等机构调解达成，可向法院申请司法确认。法院审查后若发现金额明显错误，可能不予确认或要求修正。
     
   • 起诉撤销或变更协议：若符合《民法典》第147条（重大误解）或第151条（显失公平）的情形，可向法院起诉请求撤销或变更协议。需注意，起诉需在法定期限内提出，且需承担举证责任。

预防建议：

• 签署调解协议前，务必仔细核对退费金额、计算方式及支付时间，可要求对方提供详细计算表并签字确认。
  
• 若对金额有疑问，可咨询专业人士（如律师或金融顾问）协助审核，避免因疏忽导致损失。
  

如有进一步疑问或需要具体操作指导，可直接向我咨询，我会结合您的协议内容提供针对性建议。