在相对集中执行权废止后，对于未取得建设工程规划许可证的违法事实认定后的处罚部门，主要依据相关法律法规来确定，一般情况下是由城市、县人民政府城乡规划主管部门负责处罚。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。

2. 处罚部门的确定：

   • 在相对集中执行权废止的背景下，城乡规划的执法权通常回归至原本的城乡规划主管部门，即城市、县人民政府城乡规划主管部门。这些部门负责城乡规划的制定、实施、修改、监督检查以及城乡建设管理中的违法行为的查处。
   • 因此，对于未取得建设工程规划许可证的违法建设行为，应由城市、县人民政府城乡规划主管部门进行处罚。

3. 特殊情况下的处罚部门：

   • 在某些特定区域或情况下，如开发区、新区等，可能设有专门的规划管理机构或部门。但这些机构或部门通常也是基于城市、县人民政府城乡规划主管部门的授权或委托进行执法，其处罚权最终仍来源于城乡规划主管部门。
   • 另外，如果违法建设行为涉及多个部门的管理职责，如同时违反了城乡规划、土地管理、环境保护等法律法规，那么可能需要多个部门联合执法或按照各自职责分别进行处罚。但在未取得建设工程规划许可证的情况下，主要处罚权仍归属于城乡规划主管部门。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在实际操作中，如果发现未取得建设工程规划许可证的违法建设行为，应及时向当地城市、县人民政府城乡规划主管部门举报或投诉。
   • 城乡规划主管部门在接到举报或投诉后，应依法进行调查核实，并根据违法行为的性质和情节作出相应的处罚决定。
   • 如果对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

总结来说，在相对集中执行权废止后，对于未取得建设工程规划许可证的违法事实认定后的处罚，主要由城市、县人民政府城乡规划主管部门负责。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。