结论：有经营许可但在普通库房储存危险化学品，是否会被判刑需视具体情况而定，若该行为违反了相关法律法规且情节严重，则可能构成犯罪并被判刑。
分析说明：
经营许可的范围与限制：
- 经营许可通常针对特定的经营活动和场所，如果许可中明确规定了储存危险化学品的特定条件或场所，而实际储存行为却违反了这些规定（如在普通库房而非专用仓库中储存），则可能构成违规。
危险化学品的储存规定：
- 根据相关法律法规，危险化学品的储存需要满足特定的安全条件，包括仓库的设计、建设、管理等方面。普通库房往往不具备这些条件，因此储存危险化学品可能构成违法行为。
- 具体来说，如果储存的危险化学品数量较大、种类较多或者储存方式不当，极易引发安全事故，对公共安全造成威胁，那么这种行为就可能被认定为犯罪。
法律后果：
- 如果储存危险化学品的行为违反了相关法律法规，且情节严重（如造成人员伤亡、财产损失或环境污染等），则可能构成非法储存危险物质罪或其他相关犯罪。
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法储存危险物质罪可处三年以上十年以下有期徒刑；情节严重的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。当然，具体量刑还需根据案件的具体情况和法院的判决来确定。
特殊场景：
- 如果虽然持有经营许可，但储存的危险化学品数量极少、种类单一，且储存方式相对安全，没有造成任何危害后果，那么可能不会被认定为犯罪。但即便如此，这种行为仍然可能违反相关行政法规，面临行政处罚。
行动建议：
- 立即停止违规行为：如果发现自己或他人在普通库房中储存危险化学品，应立即停止该行为，并采取措施消除安全隐患。
- 咨询专业律师：对于是否构成犯罪以及可能面临的法律后果，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见。
- 配合调查与整改：如果相关部门已经介入调查，应积极配合并提供相关证据和信息。同时，根据律师的建议进行整改，以符合法律法规的要求。
后续思考依据：
- 在处理此类案件时，法院会综合考虑多种因素，如储存的危险化学品种类、数量、储存方式、是否造成危害后果等，以确定行为的性质和法律责任。
- 因此，在判断是否会被判刑时，需要具体分析案件的事实和证据，以及相关法律法规的规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。