当员工提出合同不合理时，作为公司方，我们可以这样回复，既体现专业性，又保障双方权益：

“非常感谢您提出对合同条款的关注和疑问，我们非常重视每一位员工的意见和反馈。针对您提到的合同不合理之处，我们建议采取以下步骤来共同解决：

首先，我们鼓励双方进行友好协商。您可以具体指出合同中哪些条款您认为不合理，以及这些条款可能对您造成的具体影响。我们会认真倾听您的诉求，并依据相关法律法规，共同探讨这些条款的合理性和必要性。在协商过程中，我们愿意根据实际情况，对合同条款进行适当的调整和修订，以确保合同的公平性和合法性。

如果协商未能达成一致，您可以向当地的劳动监察部门投诉。在投诉前，建议您准备好相关证据材料，如合同文本、工作记录等，以便劳动监察部门能够全面了解情况。劳动监察部门作为政府的监管机构，有权对用人单位的劳动用工情况进行监督检查，并会依法处理查实的不合理条款。

若投诉仍未解决问题，您还可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。在申请中，请详细陈述不合理条款的具体情况及其对自身造成的损害，并提供充分证据支持自己的主张。仲裁委员会将依据事实和法律规定进行审理，并作出具有法律效力的裁决。

最后，如果仲裁结果仍不能令您满意，您还可以在规定期限内向人民法院提起诉讼。虽然诉讼程序相对复杂且耗时较长，但法院将依据更全面的证据和法律规定对劳动合同条款的合理性进行最终审查。

在整个处理过程中，我们强烈建议您注意收集和保留相关证据，如合同文本、工资条、工作证、考勤记录以及与用人单位沟通协商的记录等。这些证据对于证明您的诉求和维护自身合法权益至关重要。

我们公司一直秉持公平、公正、合法的原则与员工签订和履行劳动合同，也愿意与您共同探讨和解决合同中的任何问题。希望我们能够通过友好协商，找到一个双方都能接受的解决方案。”