当交警查到面包车存在违法行为时，会根据具体的违法情况采取相应的处理措施。以下是一些常见的处理方式，结合您提供的参考信息，我将为您详细解释：
一、超员处理
轻微超员：如果面包车超员情况不严重，交警通常会要求驾驶员立即消除违法状态，比如让超员乘客下车，并可能对驾驶员进行罚款和记分处理。例如，核载5人的面包车坐了6人，交警可能会要求转员，并对驾驶员处以罚款和记分。
严重超员：对于严重超员的面包车，交警会采取更为严厉的措施。根据相关法律法规，如果面包车从事校车业务或公路客运、旅游客运、包车客运，载客超过额定乘员100%以上或超过额定乘员7人以上的，将一律刑事立案。此外，即使不是从事这些业务，严重超员也可能面临高额罚款、记分、暂扣车辆甚至拘留等处罚。
二、非法营运处理
如果交警发现面包车存在非法营运行为，即未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营活动的，会依法进行处罚。这通常包括罚款、暂扣车辆，并可能移交交通运输部门进一步调查处理。对于涉嫌非法经营犯罪的，还会追究刑事责任。
三、其他违法行为处理
除了超员和非法营运外，面包车还可能存在其他违法行为，如未按规定期限进行安全技术检验、无证驾驶、使用伪造变造机动车号牌等。对于这些违法行为，交警也会依法进行处罚，包括罚款、记分、拘留、暂扣车辆等。
四、具体案例参考
以您提供的参考信息为例，湛江交警查处的一辆非法营运、严重超员面包车，司机被依法刑拘，并移交交通运输部门进一步调查处理；潮州交警查处的类似案件中，司机也被依法刑拘，并处以罚款。这些案例都表明了交警对面包车违法行为的严厉打击态度。
五、建议与提醒
为了避免被交警查处并受到处罚，面包车驾驶员应严格遵守交通法规，不超员、不非法营运、不驾驶存在安全隐患的车辆。同时，乘客也应提高安全意识，不乘坐超员或非法营运的面包车。
综上所述，当交警查到面包车存在违法行为时，会根据具体情况采取相应的处理措施。驾驶员和乘客都应遵守交通法规，确保行车安全。