针对您提出的两个问题，我将分别进行解答：
一、非集体成员在农村通过转让申请宅基地建房是否合法
不合法性分析：
- 根据《土地管理法》等相关法律法规，农村宅基地归农民集体所有，农民仅享有使用权而非所有权。宅基地的转让受到严格限制，转让方和受让方原则上必须均为本集体经济组织成员。非本集体经济组织成员，包括城镇居民和其他村村民，原则上不能参与宅基地的转让，更不能通过转让申请宅基地建房。
特殊情况说明：
- 在某些特殊情况下，如因继承等合法原因导致宅基地上的房屋所有权发生转移，且房屋存续的，可依法办理宅基地使用权的变更登记。但这种情况仍需符合相关法律法规和政策规定，且受让方仍需是本集体经济组织成员。
法律后果：
- 如果非集体成员通过非法手段获取宅基地并建房，将面临拆除房屋、恢复土地原状等法律后果，并可能承担相应的法律责任。
二、强占村民土地证能否推翻
强占土地证的违法性：
- 强占村民土地证是违法行为，侵犯了村民的合法权益。土地证是村民合法拥有土地使用权的凭证，任何单位和个人不得非法侵占。
推翻强占土地证的途径：
- 协商解决：首先，可以尝试与强占方进行协商，要求其归还土地证并停止侵权行为。
- 行政投诉：如果协商无果，可以向当地土地管理部门或相关政府部门进行投诉，请求其介入调查并处理。
- 法律诉讼：如果行政投诉未能解决问题，可以向人民法院提起诉讼，要求确认强占行为违法并判决强占方归还土地证、赔偿损失等。
法律建议：
- 在处理此类问题时，建议保留好相关证据，如土地证、强占行为的照片、视频、证人证言等，以便在协商、投诉或诉讼过程中证明自己的权益。
- 同时，及时咨询专业律师（即向我咨询），了解具体的法律程序和策略，以确保自己的权益得到有效维护。
总结来说，非集体成员在农村通过转让申请宅基地建房是不合法的，而强占村民土地证更是违法行为，可以通过协商、行政投诉或法律诉讼等途径来推翻。如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。