结论前置：转股时，公司章程规定债务由后股东承担，法院是否认可需分情况讨论，一般情况下，法院不会仅凭公司章程的规定就认可债务由后股东承担，但在特定情形下，如符合相关法律规定且不损害债权人利益时，该规定可能被法院认可。以下从不同角度进行分析：
一、公司章程的性质与效力
公司章程是公司设立时由全体股东共同制定，对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力的行为准则。它主要规范公司的内部管理和运营，对于公司内部的权利义务分配具有重要效力。然而，公司章程的效力原则上仅限于公司内部，不能对抗善意第三人，特别是公司的债权人。
二、债务承担的一般原则
在债务承担方面，通常遵循“债务随资产转移”的原则。也就是说，当公司的股权发生转让时，公司的债务并不当然地随之转移给新的股东。除非有明确的法律规定或者合同约定，否则新的股东（后股东）并不承担公司原有的债务。
三、公司章程规定债务由后股东承担的法院认可情况
内部约定与外部效力的区分：
- 如果公司章程中规定债务由后股东承担，这首先是一种内部约定，对股东之间具有约束力。但是，这种约定不能直接对抗公司的债权人。因为债权人并非公司章程的制定者，也不受公司章程的约束。
特定情形下的法院认可：
- 在某些特定情形下，如果公司章程中的规定符合相关法律法规的要求，且不损害债权人的利益，法院可能会认可这种规定。例如，如果后股东在受让股权时明确知晓并同意承担公司原有债务，且这种约定得到了债权人的书面同意或认可，那么法院在审理相关案件时可能会考虑这种约定。
- 另外，如果公司通过合法的减资程序，将债务转移给后股东，并按照法定程序通知了债权人，且债权人未提出异议，那么这种债务转移也可能被法院认可。但这种情况较为复杂，需要严格遵守相关法律法规的规定。
实践中的常见做法：
- 在实践中，为了避免因债务承担问题引发的纠纷，股东在转让股权时通常会与受让方签订详细的股权转让协议，明确约定债务的承担方式。如果协议中约定债务由后股东承担，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，也不损害债权人的利益，那么这种约定在股东之间是具有法律效力的。但是，对于债权人来说，他们仍然有权要求公司承担债务，除非公司已经按照法定程序进行了减资或债务转移。
四、法律建议
对于转让方：
- 在转让股权前，应全面了解公司的债务情况，并在股权转让协议中明确约定债务的承担方式。
- 如果希望将债务转移给后股东，应确保这种转移符合相关法律法规的要求，并得到债权人的书面同意或认可。
对于受让方：
- 在受让股权前，应仔细审查公司的财务状况和债务情况，避免因承担未知债务而遭受损失。
- 如果同意承担公司原有债务，应在股权转让协议中明确约定，并确保这种约定具有法律效力。
对于公司：
- 应严格遵守相关法律法规的规定，确保公司章程的合法性和有效性。
- 在进行股权转让或债务转移时，应按照法定程序通知债权人，并确保债权人的权益不受损害。
最后，公司章程规定债务由后股东承担的问题涉及复杂的法律关系和利益平衡。在实际操作中，应充分考虑各种因素，并咨询专业律师的意见，以确保相关约定的合法性和有效性。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。