当您发现自己的银行卡被公安机关冻结，而里面的钱是合法个人存款时，您可以按照以下步骤来妥善处理这个问题：
一、保持冷静，了解冻结详情
首先，不要惊慌失措，保持冷静的心态。银行卡被冻结是公安机关依法进行的调查措施，通常是因为账户资金可能与某些案件有关联。您应立即通过拨打银行客服电话或前往银行柜台，查询冻结的具体原因、金额、期限以及是哪个公安机关采取的冻结措施。银行会提供相关冻结机关的联系方式和冻结文书编号，这是您后续处理问题的重要依据。
二、主动联系办案机关，确认冻结情况
在获取了冻结机关的信息后，您应主动联系负责冻结的公安机关办案部门，进一步确认冻结的详细情况和后续处理流程。在沟通过程中，保持礼貌和耐心，如实陈述自己的情况，并询问需要提供哪些材料来证明资金的合法性。
三、根据具体情况，采取相应措施
若资金与案件无关：
- 您需要准备能证明被冻结资金与案件无关的相关材料，如合同、发票、银行流水等，以证实交易的真实性和合法性。
- 在提供充分证据的基础上，以书面形式向办案机关提出解冻申请，详细说明资金的来源、性质及与案件无关的理由。
若涉及案件但本人不知情：
- 您应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述自己所了解的情况，提供相关线索和证据，协助公安机关查明案件事实。
- 与办案机关保持密切联系，及时了解案件进展和冻结资金的后续处理方式。
若本人确实涉及违法犯罪（但您已表明资金合法，此情况仅为全面考虑）：
- 如果您确实涉及了违法犯罪行为，应认罪悔罪，主动向公安机关坦白违法犯罪事实。
- 在接受处罚后，可向公安机关说明银行卡内哪些资金是合法的个人财产，并申请解冻这部分资金。但根据您的描述，这种情况应不适用。
四、寻求法律帮助，跟进解冻进度
- 如果您对冻结行为有异议或认为侵犯了您的合法权益，应咨询专业律师寻求法律帮助。律师可以提供专业的法律分析、准备证据材料，并代表您向相关部门提出申诉或复议。
- 在提交解冻申请后，您要定期与办案机关沟通，了解解冻的进展情况。如果超过法定期限仍未解冻且无合理理由，您可以向上级公安机关或相关监督部门反映情况，督促办案机关依法处理。
五、注意事项
- 在整个处理过程中，保持冷静和理性，避免采取过激行为或盲目操作。
- 注意保护个人信息和隐私安全，在与公安机关或银行沟通时，不要泄露过多不必要的个人信息。
- 确保自己的资金来源合法合规，避免再次陷入类似的法律风险之中。
希望以上建议能对您有所帮助。面对银行卡被冻结的情况，关键在于保持冷静、积极配合调查，并通过合法途径维护自己的权益。