分公司设立的医疗机构确实可以变更负责人。这一结论主要基于以下法律和实务层面的分析：
法律层面的依据：
- 根据《医疗机构管理条例》及相关规定，医疗机构作为独立的法人实体（或虽非法人但依法独立承担民事责任的组织），其负责人是医疗机构管理的重要组成部分。当医疗机构因各种原因（如原负责人离职、退休、健康原因等）需要变更负责人时，应依法进行变更登记。
- 分公司作为总公司的分支机构，虽然不具有独立的法人资格，但其在总公司的授权范围内开展经营活动，包括设立和管理医疗机构。因此，分公司设立的医疗机构在变更负责人时，同样需要遵循相关法律法规的规定，进行必要的变更登记手续。
实务操作中的流程：
- 准备材料：通常包括变更申请书、原负责人的离职证明或免职文件、新负责人的身份证明、执业资格证明以及任命文件等。
- 提交申请：将准备好的材料提交至原登记机关（如卫生健康行政部门）进行变更登记申请。
- 审核与批准：登记机关会对提交的材料进行审核，确认无误后，会批准变更申请，并颁发新的医疗机构执业许可证或更新原有许可证上的负责人信息。
- 公告与备案：部分地区可能还要求医疗机构在变更负责人后进行公告，并将变更情况备案至相关部门。
注意事项：
- 合规性：在变更负责人过程中，必须确保所有操作符合相关法律法规的规定，避免因违规操作而引发的法律风险。
- 及时性：一旦决定变更负责人，应尽快办理变更登记手续，以确保医疗机构的正常运营和患者的权益不受影响。
- 沟通与协调：在变更过程中，应与总公司、原负责人、新负责人以及登记机关等各方进行充分沟通与协调，确保变更工作的顺利进行。
建议：如果您是分公司设立的医疗机构的负责人或管理人员，且正面临负责人变更的问题，建议您及时咨询当地卫生健康行政部门或专业律师，以了解具体的变更流程和所需材料，确保变更工作的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。