撤销公司章程条款的原因主要包括程序瑕疵、内容违法、显失公平以及违背公序良俗等情形。以下是对这些原因的详细解释：

1. 程序瑕疵：

   • 召集程序违法或违规：如果公司章程的制定或修改未按照法定程序召开股东会、董事会，或者虽召开但召集程序违反法律、行政法规或公司章程，那么基于此形成的章程条款可能因程序瑕疵而被撤销。例如，未提前通知股东召开会议，导致部分股东未能参与表决。
   • 表决方式违法或违规：若公司章程规定修改章程需经特定比例的股东通过，但实际表决时未达到该比例却通过了章程修改决议，这种表决方式的违法或违规也可能成为撤销章程条款的理由。

2. 内容违法：

   • 违反法律、行政法规的强制性规定：公司章程的内容必须符合法律、行政法规的强制性规定。如果章程中的某些条款违反了这些规定，那么这些条款可能因内容违法而被撤销。例如，章程中规定了违反劳动法规定的用工条款。
   • 与公司章程的其他条款相抵触：如果公司章程中的某个条款与公司章程的其他条款存在矛盾或冲突，且这种矛盾或冲突无法通过解释或修订来解决，那么该条款可能因与公司章程的其他条款相抵触而被撤销。不过，这种情况更多涉及章程内部的协调与修订，而非直接的撤销程序。但值得注意的是，若某条款的修改违反了公司章程中关于修改程序的明确规定，该修改决议及相应条款亦可被撤销。

3. 显失公平：

   • 严重损害特定股东的合法权益：如果公司章程的某些条款严重损害了特定股东的合法权益，导致利益失衡，那么这些条款可能因显失公平而被撤销。例如，章程中规定了不合理的股权转让限制，使得某些股东无法自由转让其股权。

4. 违背公序良俗：

   • 违背社会公共利益或善良风俗：公司章程的内容必须符合社会公共利益和善良风俗。如果章程中的某些条款违背了这些原则，那么这些条款可能因违背公序良俗而被撤销。例如，章程中规定了歧视性条款，对特定群体进行不公平对待。

撤销流程与注意事项：

• 提起诉讼：股东需在决议作出之日起六十日内向人民法院提起诉讼，请求撤销存在问题的决议及相应章程条款。
• 法院审理：法院将审查决议的召集程序、表决方式及内容是否违反法律、行政法规或公司章程。
• 判决结果：若法院认定决议存在可撤销情形，将判决撤销该决议及相应章程条款，这些条款将失去效力。
• 时间限制与举证责任：股东必须在法定期间内提起诉讼，并承担举证责任，证明决议存在可撤销的情形。因此，收集和保存相关证据至关重要。

建议：

• 加强内部管理：公司应确保章程的制定、修改和执行均符合法律法规的要求，避免程序瑕疵和内容违法。
• 充分征求意见：在制定或修改公司章程时，应充分征求各方意见，确保内容公正、合理，符合全体股东的利益。
• 及时咨询与应对：如果股东发现公司章程存在可撤销的情形，应及时咨询专业律师（即我本人），了解自身权利并采取相应的法律措施。

如有任何关于公司章程撤销或其他法律问题的疑问，请直接向我咨询，我将为你提供全面、专业的解答。