当公司法人和大股东不是同一人时，可以通过以下方式实现相互制约，以保障公司治理的平衡和各方权益：

1. 完善公司章程
   公司章程是公司的“宪法”，具有最高法律效力。可以通过章程明确规定法人和大股东的权限范围、决策程序、监督机制等。例如：

   • 限制法人单独决策的权限，要求重大事项（如对外投资、担保、修改章程等）需经股东会或董事会决议通过；
   • 设定大股东的表决权比例限制（如防止“一股独大”），或要求特定事项需经代表一定比例表决权的股东同意；
   • 明确法人职责和义务，如禁止法人未经授权以公司名义对外借款或提供担保。

2. 优化股权结构设计
   通过股权分配或协议安排，形成大股东之间的制衡关系。例如：

   • 引入其他股东（如战略投资者、员工持股平台）分散股权，避免单一大股东绝对控股；
   • 签订《股东协议》，约定股东之间的权利义务，如一致行动条款、股权转让限制、优先购买权等；
   • 设置AB股架构（如同股不同权），保障创始人或核心团队的控制权，同时吸引外部投资。

3. 强化董事会和监事会职能
   董事会是公司决策机构，监事会是监督机构，可通过以下方式发挥制衡作用：

   • 在董事会中引入独立董事或外部董事，平衡大股东对董事会的控制；
   • 明确监事会的监督权限（如财务检查、董事高管行为监督），并赋予其直接向股东会报告的权力；
   • 要求法人定期向董事会或监事会汇报工作，接受质询和监督。

4. 明确法人职责与问责机制
   通过法律文件或内部制度，对法人的行为进行规范和约束：

   • 在《法定代表人授权委托书》中明确法人的权限范围，禁止其超越授权行事；
   • 设定法人履职的考核标准，如未达标可由股东会或董事会更换法人；
   • 规定法人因故意或重大过失损害公司利益时的赔偿责任，甚至追究其法律责任。

5. 利用外部监督机制
   通过外部力量对法人和大股东形成制约：

   • 定期聘请会计师事务所进行审计，确保财务透明；
   • 引入银行、债权人等外部利益相关方，通过合同条款（如贷款协议中的控制权变更条款）对法人行为进行约束；
   • 在涉及公众利益的公司（如上市公司）中，遵守信息披露规则，接受证监会、交易所等监管机构的监督。

6. 通过诉讼或仲裁解决争议
   若法人和大股东之间发生不可调和的矛盾，可通过法律途径解决：

   • 股东可依据《公司法》提起“股东代表诉讼”，代公司起诉法人或高管侵害公司利益的行为；
   • 大股东可依据章程或协议，通过股东会决议罢免法人；
   • 双方可约定仲裁条款，通过仲裁机构快速解决纠纷。

总结：法人和大股东的制衡需要从公司章程、股权结构、治理机制、法律文件等多方面综合设计，核心是明确权责边界、建立监督机制、保障决策透明。具体方案需根据公司规模、行业特点、股东关系等因素定制，建议结合实际情况进一步沟通优化。