农村农业设施用地是否可以确权需分情况讨论，具体如下：

1. 符合规划且合法使用的农业设施用地可以确权
   根据《自然资源部农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》（自然资规〔2019〕4号），设施农业用地包括生产设施用地和附属设施用地（如直接用于农产品生产的设施、农业作业中必要配套的设施等）。若此类用地符合国土空间规划、农业发展规划，且已依法办理用地备案手续，其使用权可通过不动产登记确权发证，明确权属主体、范围及用途。
   例如：规模化养殖场的畜禽舍、温室大棚等生产设施，若经乡镇政府备案并符合规划，可申请确权。

2. 违法占用或改变用途的农业设施用地无法确权
   若农业设施用地存在以下情形，则不符合确权条件：

   • 未履行备案手续：未向乡镇政府或县级自然资源部门备案即擅自使用土地；
     
   • 超范围占用：实际用地超出备案范围或改变备案用途（如将养殖设施改为住宅）；
     
   • 占用永久基本农田：未经批准占用永久基本农田建设农业设施（需补划同等数量质量土地并经省级批准）；
     
   • 破坏耕地耕作层：在耕地上建设永久性建筑（如硬化地面、房屋）且未恢复种植条件。
     例如：在耕地上私建“大棚房”用于非农经营，属于违法用地，需拆除复垦，无法确权。

3. 历史遗留问题的处理需结合地方政策
   对于2019年《通知》实施前已建成的农业设施用地，若符合当时政策但未完善手续，部分地区允许通过补办备案、补缴费用等方式补正后确权；若属于违法用地，则需依法处置后视情况处理。
   建议：向当地自然资源部门查询用地是否纳入“设施农业用地监管平台”，并确认是否符合补正条件。

行动建议：

• 若您的农业设施用地符合规划且已备案，可携带用地合同、备案证明等材料向当地不动产登记中心申请确权；
  
• 若存在用地争议或手续不全，建议先通过乡镇政府协调补办手续，再申请确权；
  
• 涉及违法用地的，需配合整改（如拆除违建、恢复耕地）后，再按合法程序处理。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或地方政策差异。