结论：关于您提出的“知道本人房屋被自家兄弟占有16年，可否起诉”的问题，答案是肯定的，您有权起诉，但具体能否胜诉及获得何种救济，需根据房屋权属、占有性质及诉讼时效等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、房屋权属是起诉的前提

1. 若房屋确属您所有：根据《民法典》第二百三十五条，无权占有不动产或者动产的，权利人可以请求返还原物。您作为房屋所有权人，有权要求兄弟返还房屋，并可通过诉讼主张权利。
2. 若房屋权属存在争议：如房屋登记在兄弟名下，或存在共有、继承等争议，您需先通过确权之诉明确房屋归属，再主张返还。此时，起诉的焦点在于证明您对房屋享有所有权（如购房合同、付款凭证、继承文件等）。

二、占有性质影响诉讼请求

1. 若兄弟为“无权占有”：即兄弟未经您同意，擅自占用房屋，且无合法依据（如租赁合同、借用协议等），您可直接起诉要求返还房屋，并可主张赔偿占用期间的损失（如租金损失）。
2. 若兄弟为“有权占有”：如兄弟基于租赁、借用等合法关系占有房屋，您需先终止该合法关系（如解除租赁合同），再主张返还。若兄弟拒不返还，您可起诉要求返还并赔偿损失。

三、诉讼时效是关键限制

1. 一般诉讼时效：根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
2. 特殊情形下的时效起算：
   • 持续占有：若兄弟持续占有房屋，且您一直不知情或无法行使权利，诉讼时效可能尚未起算。但需注意，若您曾明确表示放弃权利或长期未主张，可能被认定为“知道或应当知道权利受损”。
   • 中断与延长：若您曾向兄弟主张权利（如发函、报警等），或兄弟承认占有事实，诉讼时效可能中断并重新计算。此外，若因不可抗力或其他正当理由无法行使权利，诉讼时效可中止或延长。
3. 16年占有的影响：若兄弟已占有房屋16年，且您一直未主张权利，可能面临诉讼时效届满的风险。但若存在上述特殊情形（如持续占有、时效中断等），您仍可能获得法院支持。

四、法律建议与行动步骤

1. 收集证据：包括房屋权属证明（如房产证、购房合同）、兄弟占有的证据（如照片、视频、证人证言）、您曾主张权利的证据（如发函记录、报警回执等）。
2. 咨询律师：由于案件涉及房屋权属、占有性质及诉讼时效等复杂法律问题，建议您咨询专业律师，进行详细案情分析并制定诉讼策略。
3. 提起诉讼：若证据充分且诉讼时效未届满，您可向房屋所在地人民法院提起诉讼，要求兄弟返还房屋并赔偿损失。

最后，房屋被兄弟占有16年，您有权通过法律途径维护自身权益。但具体能否胜诉及获得何种救济，需根据房屋权属、占有性质及诉讼时效等因素综合判断。如有进一步疑问或需法律帮助，请直接向我咨询。