仲裁案卷丢失后，首先应立即联系仲裁机构确认丢失情况，并根据不同阶段采取相应补救措施。具体处理方式如下：

1. 联系仲裁机构确认丢失情况
   发现案卷丢失后，第一时间与受理案件的仲裁委员会取得联系，要求其出具书面说明，明确丢失的具体环节（如立案、审理、归档阶段）及责任归属。若仲裁机构承认管理过失，可要求其启动内部追责程序，并同步推进补救措施。

2. 分阶段补救措施

   • 仲裁审理阶段丢失：
     若案件尚未审结，可依据《仲裁法》第40条要求仲裁庭重新调取证据或补充质证。例如，要求当事人重新提交关键证据原件，或通过公证、鉴定等方式固定证据效力。若因丢失导致程序违法，可依据《仲裁法》第58条申请撤销仲裁裁决。
     
   • 已结案归档阶段丢失：
     若裁决已生效，可向仲裁机构申请调取电子卷宗或备份材料。根据《档案法》第19条，仲裁机构有义务保存案卷至少20年，若因保管不善导致丢失，可要求其出具加盖公章的案卷复印件或情况说明，作为后续执行的替代材料。

3. 向监督部门投诉或起诉
   若仲裁机构拒绝配合或补救无效，可向其上级主管部门（如地方司法局）投诉，要求介入调查。若因丢失导致实际损失（如无法执行裁决），可依据《民法典》第1165条，以仲裁机构未尽到安全保管义务为由，向法院提起财产损害赔偿诉讼。

提示：仲裁案卷是认定事实、适用法律的核心依据，丢失可能直接影响案件结果。建议同步收集所有能证明案件事实的辅助证据（如聊天记录、转账凭证等），并尽快启动上述程序。如有具体案件细节需要分析，可直接向我咨询。