当在起诉过程中遇到被起诉主体（如公司）注销的情况时，这确实是一个比较复杂且需要谨慎处理的问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、被起诉主体不能直接注销的原因
在诉讼过程中，被起诉主体（如公司）是不能直接注销的。这是因为公司注销意味着法人资格的消灭，如果公司在涉及诉讼时直接注销，将可能导致债权人的权益无法得到保障，诉讼也无法正常进行。此外，工商行政管理部门通常也不会受理处于诉讼过程中的公司的注销申请，以确保法律事务的妥善了结。
二、被起诉主体注销的合法途径
协商解决：
- 如果公司希望注销，首先应积极与原告沟通，争取达成和解协议。通过协商解决纠纷后，公司需要清理债权债务、完成税务注销等法定程序，之后方可向工商行政管理部门申请注销登记。
等待判决并执行：
- 如果无法协商解决，公司应等待法院判决，并按判决结果履行相应义务。在履行完毕后，公司可以按照正常的注销流程完成注销。
三、被起诉主体试图注销的法律后果
- 如果公司试图通过注销来逃避法律责任，法院有权采取一系列强制措施，如冻结银行账户、查封财产等，以确保判决的执行。
- 在极端情况下，公司法定代表人及相关责任人甚至可能被追究刑事责任，因为这种行为可能构成妨碍诉讼或逃避债务等违法行为。
四、股东在面对被起诉主体注销时的权益保护
如果股东认为自身权益受到侵害，且被起诉主体（公司）试图注销以逃避责任，股东可以采取以下措施：
提起诉讼：
- 股东可以根据具体情况选择直接诉讼或代表诉讼。直接诉讼适用于公司法定代表人、高级管理人员等行为直接损害股东个人利益的情况；代表诉讼则适用于公司合法权益受到他人侵害，而公司怠于追究侵权人责任的情况。
准备起诉材料：
- 股东需要准备起诉状，明确原告（股东）、被告的基本信息，诉讼请求及事实理由，证据和证据来源等。
- 同时，股东还需要收集支持诉讼请求的相关证据，如公司章程、股东协议、财务报表、会议记录等。
- 提供证明股东身份的文件，如股东名册、出资证明书等也是必不可少的。
选择管辖法院并提起诉讼：
- 公司诉讼一般由公司住所地人民法院管辖。股东需要将准备好的起诉材料提交给有管辖权的人民法院，并缴纳诉讼费用。
- 法院受理后，会向被告送达起诉状副本，并安排开庭审理。股东需按法律规定和法院要求进行举证、质证和辩论。
五、建议
- 在遇到复杂或不确定的法律问题时，建议咨询专业的法律顾问或律师以获取专业意见。他们可以根据具体情况为您提供更详细、更具体的法律建议。
- 同时，股东也应密切关注公司的经营状况和法律事务，及时采取措施保护自己的合法权益。
综上所述，当在起诉过程中遇到被起诉主体注销的情况时，股东应了解相关法律规定和程序，积极采取措施保护自己的权益。希望以上解答能对您有所帮助。