针对您提出的问题，即非在医院出生导致无法办理出生证明，进而影响上户口的情况，且您和您的配偶是合法夫妻，以下是我为您提供的详细解答和办理流程：
一、情况分析
首先，需要明确的是，即使婴儿非在医院出生，也仍然有办法办理出生证明和上户口。关键在于如何获取有效的出生证明或相关替代证明文件。
二、办理出生证明
向当地卫生计生部门申请补发：
- 如果原本应该有的出生证明丢失或未办理，您可以向当地的卫生计生部门（通常是妇幼保健院或相关机构）申请补发新的出生证明。
- 申请时可能需要提供一些证明材料，如父母的身份证、结婚证、婴儿的姓名等，以及可能需要的社区（村委会）出具的证明或接生人员证明。
无出生证明时的替代方案：
- 如果确实无法获得出生证明，您可以凭当地社区（村委会）出具的证明、接生人员证明或医院出具的母亲住院临床病历（如果有的话）以及公安派出所的调查材料来办理落户手续。
- 这些材料需要能够证明婴儿的出生事实以及与父母的关系。
三、办理上户口
在获得了有效的出生证明或相关替代证明文件后，您可以按照以下步骤办理上户口：
准备所需材料：
- 出生证明或相关替代证明文件。
- 父亲或母亲的居民户口簿。
- 父母的结婚证。
- 可能需要的其他材料，如父母共同签署的确定民族成份声明书（如果父母民族成份不相同）。
前往落户地公安办证中心或派出所：
- 携带上述材料，前往父亲或母亲常住户口所在地的公安机关（通常是公安办证中心或派出所）申报户口登记。
- 在那里，您需要填写《入户申请表》并提交所有相关材料。
等待审批：
- 公安机关会对您的申请进行审批。在法定时限内（通常是1个工作日），您会得到审批结果。
- 如果审批通过，您的婴儿就会被正式登记在户口簿上。
四、注意事项
- 确保材料的真实性：在办理过程中，确保提供的所有材料都是真实有效的。任何虚假材料都可能导致申请被拒绝或面临法律责任。
- 咨询当地政策：不同地区的具体政策可能有所不同。在办理前，建议您先咨询当地公安机关或相关部门，了解具体的办理流程和所需材料。
- 保持耐心和配合：办理户口登记可能需要一些时间和耐心。在办理过程中，请积极配合公安机关的工作，按照他们的要求提供所需材料和信息。
希望以上解答能够帮助您顺利办理婴儿的户口登记。如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询当地公安机关或相关部门。