是的，辞职时公司应当结清工资。这是基于我国相关劳动法律法规的规定，以下从不同角度为你详细分析：

法律规定角度

根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，无论你是主动辞职还是被公司解雇，在离职的那一刻，公司都有义务将你的工资结算清楚。

实际操作角度

1. 正常辞职流程：如果你按照公司的规定提前提交了辞职申请，并且在离职前完成了所有的工作交接，那么公司通常会在你离职的当天或最近的一个发薪日将你的工资结清。这包括你应得的底薪、奖金、津贴等所有收入。

2. 特殊情况处理：如果公司因为某些原因（如财务流程繁琐、资金周转问题等）无法在你离职时立即结清工资，那么它应该与你协商一个具体的支付时间，并确保这个时间不会过长。根据相关法律规定，这个时间通常不应超过下一个发薪日。

3. 未结清工资的后果：如果公司在你离职后未按照约定时间结清工资，你有权向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。一旦劳动监察部门或劳动仲裁机构确认公司存在违法行为，公司不仅需要支付你应得的工资，还可能需要支付额外的赔偿金。

法律建议角度

1. 保留证据：在离职前，确保你保留了所有与工资相关的证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等。这些证据将有助于你在必要时维护自己的权益。

2. 与公司沟通：如果公司在你离职时未结清工资，首先尝试与公司进行友好沟通，了解原因并协商解决方案。如果沟通无果，再考虑采取法律手段。

3. 寻求法律帮助：如果你对公司的行为感到不满或无法与公司达成一致，可以向我咨询或寻求其他专业律师的帮助。我们可以为你提供具体的法律建议和指导，帮助你维护自己的合法权益。

总之，辞职时公司应当结清工资是法律规定的义务。如果你遇到公司未结清工资的情况，不要慌张，按照上述建议采取行动即可。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。