付款申请书完全可以使用电子版形式，但需满足一定条件以确保其法律效力。具体分析如下：

1. 法律认可性
   根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。因此，电子版付款申请书在法律上是被认可的，只要其内容清晰、完整，能够证明双方的真实意思表示。

2. 有效性条件
   为确保电子版付款申请书的有效性，需满足以下条件：

   • 真实性：申请书内容需真实反映双方交易情况，无篡改或伪造。
     
   • 完整性：申请书应包含所有必要信息，如付款金额、事由、收款方信息等。
     
   • 可验证性：建议通过电子签名、时间戳等技术手段，确保申请书的来源和签署时间可追溯。
     
   • 保存与调取：双方应妥善保存电子版申请书，并确保在需要时能够随时调取查用。

3. 实践建议

   • 使用可靠平台：选择安全、可靠的电子文档传输或存储平台，如加密邮件、专业电子合同平台等。
     
   • 明确约定：在交易合同中明确约定电子版付款申请书的法律效力及使用方式，避免后续争议。
     
   • 备份与存档：双方均应备份电子版申请书，并妥善存档，以备不时之需。

4. 特殊情形注意
   若涉及大额交易或特定行业（如金融、医疗等），可能需遵守更严格的监管要求。此时，建议咨询专业律师，确保电子版付款申请书符合相关法规及行业规范。

总结：电子版付款申请书在法律上是可行的，但需确保其真实性、完整性、可验证性，并妥善保存。如有任何疑问或需要进一步指导，欢迎随时向我咨询。