结论：自行修改车机系统是否违法，需根据修改的具体内容、目的以及是否影响车辆安全性能等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从车辆安全性能角度：

   • 若修改影响安全：如果自行修改车机系统导致车辆的安全性能受到影响，比如干扰了车辆的行驶稳定系统、制动系统或安全气囊等关键安全部件的正常工作，那么这种行为很可能违反了《中华人民共和国道路交通安全法》中关于车辆安全性能的规定。根据该法，车辆必须保持安全技术状况良好，任何改装或修改都不得降低车辆的安全性能。
   • 法律后果：一旦因此导致交通事故，修改者可能需要承担相应的法律责任，包括民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

2. 从车辆改装规定角度：

   • 非法改装定义：根据相关规定，非法改装车辆是指未经有关部门批准，擅自改变车辆结构、构造或者特征的车辆。车机系统作为车辆的重要组成部分，其修改若涉及车辆结构、构造或特征的改变，且未经相关部门批准，则可能构成非法改装。
   • 具体规定：不同地区对于车辆改装的具体规定可能有所不同，但一般来说，任何影响车辆安全、环保或行驶性能的改装都需要经过相关部门的审批。因此，在修改车机系统前，建议先了解当地的具体规定。

3. 从软件版权与知识产权角度：

   • 软件版权：车机系统中的软件通常受到版权保护。未经软件版权所有者的许可，擅自复制、修改或分发其软件可能构成侵权行为。
   • 知识产权：如果修改车机系统涉及对原有知识产权的侵犯，比如破解加密技术、绕过授权机制等，那么这种行为也可能违反相关法律法规。

4. 从实际操作与风险角度：

   • 操作风险：自行修改车机系统可能涉及复杂的技术操作，如果操作不当，可能导致车机系统故障、车辆无法启动或行驶中出现意外情况。
   • 保修失效：许多车辆制造商在保修条款中明确规定，未经授权的改装或修改将导致保修失效。因此，自行修改车机系统可能使车主失去享受保修服务的权利。

建议：

• 在考虑修改车机系统前，务必了解当地的相关法律法规和车辆制造商的规定。
• 如果确实需要修改车机系统，建议寻求专业、合法的改装服务，并确保修改不会影响车辆的安全性能和行驶性能。
• 如有任何疑问或不确定之处，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。