农村自建房过了诉讼时效，并不意味着完全不受法律保护，但可能会影响权利人通过法律途径实现其权利的效果。以下从几个方面为你详细分析：

一、诉讼时效的基本概念

诉讼时效，是指权利人在一定期间内不行使权利，即在某种程度上丧失请求利益的时效制度。在民法中，诉讼时效的设定是为了促使权利人及时行使权利，维护社会秩序的稳定。对于农村自建房相关的纠纷，如房屋所有权确认、宅基地使用权争议等，同样适用诉讼时效的规定。

二、诉讼时效的具体规定

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果权利人在知道或应当知道其权利受到侵害之日起三年内未行使权利，那么其请求人民法院保护其权利的诉讼时效期间即已届满。但需注意，诉讼时效届满并不意味着权利人的权利完全消灭，而是丧失了胜诉权，即权利人仍然可以向法院提起诉讼，但法院可能不再支持其诉讼请求。

三、农村自建房诉讼时效的特殊性

对于农村自建房而言，由于其涉及宅基地使用权等特殊权益，诉讼时效的适用可能存在一定的特殊性。例如，宅基地使用权是农村村民基于其身份而享有的特殊权利，具有无偿性、永久性和身份依附性等特点。因此，在宅基地使用权争议中，即使诉讼时效已经届满，法院在判决时也可能考虑宅基地使用权的特殊性，对权利人的请求给予一定的保护。但这并不意味着诉讼时效在农村自建房纠纷中完全不适用，而是需要根据具体情况进行具体分析。

四、诉讼时效届满后的法律后果

1. 胜诉权丧失：如前所述，诉讼时效届满后，权利人丧失的是胜诉权，而非实体权利。这意味着权利人仍然可以向法院提起诉讼，但法院可能不再支持其诉讼请求。
2. 义务人提出抗辩：在诉讼过程中，如果义务人提出诉讼时效抗辩，且法院认定诉讼时效确实已经届满，那么权利人的诉讼请求将不会被支持。
3. 权利人仍可主张权利：尽管诉讼时效届满后权利人丧失了胜诉权，但其仍然可以通过其他途径主张其权利，如与义务人进行协商、寻求调解等。

五、建议与措施

1. 及时行使权利：为了避免诉讼时效届满带来的不利后果，权利人应及时行使权利，如及时向法院提起诉讼或采取其他法律措施保护其权益。
2. 保留证据：在行使权利的过程中，权利人应保留好相关证据，如房屋所有权证、宅基地使用权证、相关协议等，以便在诉讼过程中证明其权利的存在和合法性。
3. 咨询专业律师：如果你对农村自建房诉讼时效问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我可以根据你的具体情况提供专业的法律意见和建议。

总结来说，农村自建房过了诉讼时效并不意味着完全不受法律保护，但可能会影响权利人通过法律途径实现其权利的效果。因此，权利人应及时行使权利并保留好相关证据，以便在必要时维护其合法权益。