关于登记证书过期几十年后根据哪条法律自动失效的问题，这实际上取决于具体的登记证书类型及其相关的法律法规。不过，我可以就一般情况下的登记证书失效原则，结合您提供的参考信息，给出一个较为全面的解答。

首先，需要明确的是，不同类型的登记证书（如机动车登记证书、宗教活动场所登记证书等）可能由不同的法律法规进行规范，因此其失效的具体条件和程序也可能有所不同。

1. 机动车登记证书：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第九条第一款和《机动车登记规定》第四十一条等相关规定，机动车登记证书在特定情形下（如达到国家强制报废标准且机动车所有人逾期不办理注销登记、机动车登记后被依法撤销等）会被公告作废。
   • 然而，这些规定并未直接说明“过期几十年”的机动车登记证书会自动失效。实际上，机动车登记证书的失效通常与机动车的状态（如是否报废、是否被撤销等）相关，而非单纯与时间有关。
   • 如果机动车已经达到报废标准或被依法撤销，且机动车所有人未按规定办理相关手续，那么机动车登记证书可能会被公告作废。但这一过程并非由“过期几十年”这一条件直接触发。

2. 宗教活动场所登记证书及相关负责人证件：

   • 根据您提供的参考信息，宗教活动场所负责人相关证件的失效通常与相关法律法规的废止或修订有关。
   • 例如，1994年的《宗教活动场所登记办法》已被2005年的《宗教活动场所设立审批和登记办法》废止，而后者又于2023年被《宗教活动场所管理办法》全面废止。随着这些法规的废止，依据它们核发的证件也相应失去了法律效力。
   • 在这种情况下，证件的失效并非由“过期”这一条件决定，而是由法规的废止直接导致。

一般原则：

• 对于大多数登记证书而言，其失效通常与证书所关联的主体（如机动车、宗教活动场所等）的状态变化或相关法律法规的废止、修订有关。
• 单纯的时间因素（如“过期几十年”）通常不是决定登记证书是否失效的直接条件。
• 要确定特定登记证书是否已失效，需要查阅其相关的法律法规，并了解证书所关联主体的当前状态。

建议：

• 如果您持有某种登记证书并担心其是否已失效，建议您首先查阅该证书相关的法律法规或咨询相关主管部门。
• 提供证书的具体类型、颁发机构、颁发时间以及您所了解的相关情况，以便主管部门能够给出准确的答复。

综上所述，登记证书的失效并非单纯由时间因素决定，而是与证书所关联主体的状态变化或相关法律法规的废止、修订有关。因此，要确定特定登记证书是否已失效，需要具体分析其相关情况。