针对您提出的“违纪事实材料签名造假但机关处分机关拒不承认，申请司法鉴定应向哪里申请”的问题，以下是我的详细解答：

1. 司法鉴定申请的受理机构：

   • 一般来说，司法鉴定申请应当向具有相应资质的司法鉴定机构提出。这些机构通常是由司法行政部门登记管理的，具备进行各类司法鉴定的专业能力和条件。
   • 在您的情况下，由于涉及的是签名真伪的鉴定，您应当寻找一家具有文书鉴定资质的司法鉴定机构进行申请。

2. 申请司法鉴定的流程：

   • 准备材料：您需要准备相关的违纪事实材料、签名样本（包括可能的真迹和假迹）、以及任何其他能够支持您主张的证据材料。
   • 提交申请：向选定的司法鉴定机构提交书面申请，并附上所有准备好的材料。申请中应明确说明鉴定的目的、要求和理由。
   • 缴纳费用：根据司法鉴定机构的收费标准缴纳鉴定费用。费用标准通常会在机构的官方网站或公告中明确列出。
   • 等待鉴定：司法鉴定机构在收到申请和材料后，会进行审查并决定是否受理。如果受理，机构会安排鉴定人员进行鉴定，并出具鉴定意见书。

3. 针对机关拒不承认的处理建议：

   • 保留证据：确保您保留了所有与签名造假相关的证据，包括但不限于违纪事实材料、签名样本、证人证言等。
   • 沟通协商：在申请司法鉴定之前，您可以尝试与处分机关进行沟通协商，说明您的情况和主张，并要求其重新审查或承认签名造假的事实。
   • 法律途径：如果沟通协商无果，且司法鉴定结果支持您的主张，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这可能包括提起行政复议或行政诉讼等。

4. 注意事项：

   • 选择正规机构：确保您选择的司法鉴定机构是正规、有资质的，以避免因机构不正规而导致的鉴定结果无效或不被认可的情况。
   • 及时申请：一旦发现签名造假的情况，应尽快申请司法鉴定，以免因时间拖延而导致证据灭失或难以收集。
   • 配合鉴定：在鉴定过程中，您应积极配合鉴定人员的工作，提供必要的协助和信息，以确保鉴定的顺利进行。

总结来说，针对您的情况，您应当向具有文书鉴定资质的司法鉴定机构申请司法鉴定，以确认签名的真伪。同时，您也应保留好相关证据，并与处分机关进行沟通协商。如果沟通无果且鉴定结果支持您的主张，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。如果您在申请司法鉴定或处理相关纠纷过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询。