如果起诉侵权时发现对方公司已注销，您仍可通过以下途径主张权利，但需根据注销时的具体情况调整策略：

1. 核查公司注销程序是否合法
   根据《公司法》及《公司登记管理条例》，公司注销前需完成清算程序，包括成立清算组、通知债权人、公告清算等。若公司未依法履行清算义务（如未通知已知债权人、虚假清算报告等），您可主张清算组成员（通常为股东或董事）承担赔偿责任。
   法律依据：《公司法》第183条、第189条；《公司法司法解释二》第11-20条。

2. 追索未清算财产或股东责任

   • 若公司注销时存在未清偿债务：根据《公司法司法解释二》第20条，股东或第三人在公司注销时承诺对公司债务承担责任的，您可直接起诉该股东或第三人。
     
   • 若公司未经合法清算即注销：股东可能需对公司债务承担连带清偿责任，尤其当股东存在滥用公司法人独立地位、逃避债务等行为时（《公司法》第20条）。

3. 起诉清算组成员或实际控制人
   若清算组未依法履行通知或公告义务，导致您未能申报债权，您可起诉清算组成员要求赔偿损失。若公司实际控制人操纵注销程序逃避债务，亦可追究其责任。

4. 申请恢复执行或追加被执行人
   若您已取得生效判决但未执行，公司注销后，可向法院申请追加符合条件的股东或第三人为被执行人（需满足《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第21-22条条件）。

行动建议：

1. 立即调取公司工商内档，核查注销时间、清算组成员、债权人公告记录等关键信息；
   
2. 收集证据证明公司注销时存在未清偿债务或非法清算行为（如未通知您的书面材料、虚假清算报告等）；
   
3. 根据具体情况选择起诉清算组成员、股东或实际控制人，或申请恢复执行。
   

提示：公司注销不意味着债务消灭，但需主动通过法律程序追责。若涉及复杂股权结构或财产转移，建议尽快委托律师介入调查，避免证据灭失。如有进一步疑问，可直接向我提供具体案情，我会为您详细分析。