企业使用智慧发票系统委托他人开具发票，责任承担需根据具体情况判断，主要涉及委托方（企业）和受托方的责任划分。以下分情况详细说明：

1. 若受托方在委托范围内合法开具发票，但因系统故障或数据错误导致发票问题
   若智慧发票系统本身存在技术缺陷（如数据传输错误、系统漏洞），或受托方因操作失误（如输入错误信息）导致发票内容与实际交易不符，一般由受托方承担直接责任，但企业作为委托方需承担审核义务。若企业未尽到合理审核（如未核对发票与合同、付款记录的一致性），可能因“未履行管理职责”被税务机关追责，需补缴税款、滞纳金，甚至面临罚款。

2. 若受托方超出委托范围或故意虚开发票
   若受托方未经企业同意，擅自修改发票金额、品目，或为非实际交易开具发票（如“富余票”交易），受托方构成虚开发票行为，需承担行政责任（如罚款）或刑事责任（如虚开发票罪）。但企业若明知受托方虚开仍委托，或未对受托方资质、行为进行有效监管，企业可能被认定为共同违法或存在过错，需承担连带责任，包括补税、罚款，甚至刑事风险。

3. 若因企业提供虚假信息导致发票问题
   若企业向受托方提供的交易信息（如合同、付款记录）本身虚假，受托方基于企业提供的信息开具发票，企业作为信息提供方需承担主要责任。受托方若已尽到形式审查义务（如核对企业提供的资料），一般不承担责任；但若受托方明知信息虚假仍开具，则需与企业共同担责。

建议：

• 企业应选择具备合法资质、信誉良好的受托方，并在委托合同中明确双方权利义务（如发票内容审核、系统操作规范、违约责任等）；
  
• 定期检查智慧发票系统运行情况，确保数据准确、传输安全；
  
• 保留交易合同、付款记录、发票核对记录等证据，以备税务机关核查；
  
• 若发生发票问题，立即停止委托行为，配合税务机关调查，并根据责任划分积极主张权利或承担义务。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据材料为您详细分析。